94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6454 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6454  alpha/beta hydrolase fold family protein  100 
 
 
318 aa  643    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0452177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1295  alpha/beta hydrolase fold family protein  62.78 
 
 
321 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.600627  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3932  hypothetical protein  54.84 
 
 
345 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0930159  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3558  hypothetical protein  52.88 
 
 
345 aa  329  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.85128  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4830  alpha/beta hydrolase fold family protein  46.91 
 
 
316 aa  278  9e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101446  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5871  alpha/beta hydrolase fold protein  48.7 
 
 
309 aa  271  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0582  alpha/beta hydrolase fold family protein  46.5 
 
 
331 aa  265  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2582  hypothetical protein  45.57 
 
 
330 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000271962  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2051  hypothetical protein  45.06 
 
 
340 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2114  hypothetical protein  45.06 
 
 
340 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2068  hypothetical protein  45.06 
 
 
340 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35400  lysophospholipase  46.13 
 
 
339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2433  alpha/beta hydrolase fold protein  46.75 
 
 
335 aa  240  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.206137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12869  hypothetical protein  42.47 
 
 
346 aa  236  3e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000151366  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0467  hypothetical protein  46.84 
 
 
323 aa  235  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal  0.183079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1697  hypothetical protein  43.26 
 
 
332 aa  228  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.161313  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0606  alpha/beta hydrolase fold protein  44.59 
 
 
353 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.111252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4053  hypothetical protein  46.2 
 
 
346 aa  225  9e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748794  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1957  hypothetical protein  39.02 
 
 
335 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0441772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2299  hypothetical protein  45.68 
 
 
340 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.353912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32210  lysophospholipase  41.01 
 
 
369 aa  222  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0544  alpha/beta hydrolase fold protein  45.36 
 
 
337 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708178 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2131  alpha/beta hydrolase fold family protein  42.32 
 
 
353 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106184  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0036  alpha/beta hydrolase fold family protein  40.44 
 
 
345 aa  206  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1960  alpha/beta hydrolase fold protein  38.39 
 
 
341 aa  205  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1558  hypothetical protein  41.54 
 
 
398 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00165384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  40.91 
 
 
320 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12270  lysophospholipase  39.17 
 
 
369 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0689  hydrolase alpha/beta fold family protein  38.8 
 
 
361 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.332204 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0569  hypothetical protein  38.87 
 
 
354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00639169 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3164  alpha/beta hydrolase fold protein  41.03 
 
 
331 aa  189  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2115  hypothetical protein  37.7 
 
 
340 aa  189  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.973096  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2222  putative lysophospholipase  38.27 
 
 
336 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1959  alpha/beta hydrolase fold protein  37.62 
 
 
332 aa  179  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000114749 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2223  hypothetical protein  32.95 
 
 
361 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0879  hypothetical protein  34.66 
 
 
334 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.198011  normal  0.516694 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09000  lysophospholipase  38.99 
 
 
341 aa  169  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.157222  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3165  alpha/beta hydrolase fold family protein  37.85 
 
 
341 aa  149  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0594488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1698  alpha/beta hydrolase fold family protein  39.34 
 
 
313 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
284 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  30.46 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 
277 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  27.03 
 
 
286 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
275 aa  53.1  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 
559 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3329  hypothetical protein  36 
 
 
343 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.834886  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  25.26 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1696  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  30.58 
 
 
307 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  23.36 
 
 
329 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
279 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  24.55 
 
 
289 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  28.7 
 
 
330 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  32.52 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 
289 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 
289 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 
276 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  33.04 
 
 
306 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  30.37 
 
 
277 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  21.79 
 
 
324 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
287 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  33.63 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 
281 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
278 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  33.33 
 
 
279 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  32.14 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  29.29 
 
 
324 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1084  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
335 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  32.14 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  32.14 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  32.14 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.05 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  32.14 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
324 aa  43.5  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 
313 aa  43.5  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1860  Alpha/beta hydrolase  25.68 
 
 
329 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.0180917 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  32.14 
 
 
280 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  28.06 
 
 
280 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  32.14 
 
 
280 aa  43.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2883  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 
594 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752135  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2235  conserved hypothetical protein  32.11 
 
 
585 aa  43.1  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01377  hypothetical protein  32.11 
 
 
585 aa  43.1  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.748745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1493  hypothetical protein  32.11 
 
 
585 aa  42.7  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01365  predicted hydrolase  32.11 
 
 
585 aa  43.1  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.693109  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2248  hypothetical protein  32.11 
 
 
585 aa  43.1  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.555359  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1591  hypothetical protein  31.19 
 
 
585 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
287 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>