More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4727 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4727  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  100 
 
 		 337 aa  677    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3576  Resolvase domain protein  57.03 
 
 		 259 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  hitchhiker  0.005664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0042  resolvase domain-containing protein  57.76 
 
 		 236 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 		 201 aa  110  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  39.56 
 
 		 197 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2544  hypothetical protein  78.79 
 
 		 104 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  36.71 
 
 		 176 aa  92  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  33.18 
 
 		 206 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  35.58 
 
 		 198 aa  90.1  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3966  hypothetical protein  68.85 
 
 		 66 aa  89.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  35.67 
 
 		 197 aa  89.4  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 199 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  37.97 
 
 		 188 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  35.26 
 
 		 186 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  37.58 
 
 		 210 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  36.21 
 
 		 193 aa  87  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  35.22 
 
 		 205 aa  86.7  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  33.66 
 
 		 182 aa  86.7  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.81 
 
 		 194 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  35.26 
 
 		 187 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  31.5 
 
 		 185 aa  84.7  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  35.03 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  36.6 
 
 		 184 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  35.03 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  32.79 
 
 		 184 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  31.84 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  31.5 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  31.5 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  32 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  35.03 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  36.31 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  36.84 
 
 		 201 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  36.36 
 
 		 201 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  32.84 
 
 		 188 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  34.97 
 
 		 189 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  36.25 
 
 		 209 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  32.43 
 
 		 198 aa  82.4  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  38.16 
 
 		 183 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  37.66 
 
 		 184 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  36.65 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  34.84 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  36.65 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  36.31 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  35.19 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  30.85 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  36.54 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  35.67 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  34.29 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  34.76 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  34.32 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  36.77 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  35.26 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  33.01 
 
 		 188 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  34.42 
 
 		 197 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  33.55 
 
 		 190 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  35.67 
 
 		 204 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  35.67 
 
 		 204 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  35.67 
 
 		 204 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  33.55 
 
 		 187 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  33.55 
 
 		 188 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  30.35 
 
 		 196 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  34.42 
 
 		 197 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  30.35 
 
 		 192 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  29.85 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  29.85 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  38.89 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  34.83 
 
 		 180 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  33.76 
 
 		 213 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  36.77 
 
 		 189 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  34.86 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  29.12 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  32 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  32 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  34.86 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  31.86 
 
 		 184 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  37.88 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  38.16 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  33.76 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  37.88 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  34.62 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  34.59 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  32.32 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  35.03 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  30.5 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  37.75 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  32.77 
 
 		 188 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  35.03 
 
 		 197 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  33.53 
 
 		 189 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  36.18 
 
 		 186 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  29.67 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  37.06 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  34.05 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  35.67 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  30.81 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  30.81 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  33.7 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>