More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2839 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  100 
 
 		 228 aa  444  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  92.95 
 
 		 228 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1606  two component transcriptional regulator  69.64 
 
 		 230 aa  297  8e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.688459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2243  response regulator receiver protein  69.47 
 
 		 226 aa  285  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0170584  normal  0.321433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4873  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.4 
 
 		 228 aa  270  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0727597  normal  0.414949 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4422  response regulator receiver  61.67 
 
 		 237 aa  268  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1768  two component transcriptional regulator  62.28 
 
 		 229 aa  268  7e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0372211  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1781  response regulator receiver  61.95 
 
 		 226 aa  266  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.365073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3826  response regulator receiver  60.18 
 
 		 228 aa  264  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0204609  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7254  response regulator receiver protein  60.18 
 
 		 225 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.122444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.16 
 
 		 233 aa  248  4e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00866984  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6985  two component transcriptional regulator  62.17 
 
 		 229 aa  248  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0162975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.52 
 
 		 235 aa  245  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4856  two component transcriptional regulator  55.95 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0324014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2454  response regulator receiver  55.07 
 
 		 334 aa  238  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.811467  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5007  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.83 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0076  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 224 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.44 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  49.11 
 
 		 222 aa  192  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 222 aa  188  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  46.88 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 222 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  44.74 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.59 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 236 aa  174  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  39.22 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  39.22 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 230 aa  171  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 226 aa  171  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  38.36 
 
 		 239 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  38.36 
 
 		 239 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  38.36 
 
 		 239 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  38.36 
 
 		 239 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  38.36 
 
 		 239 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  38.36 
 
 		 239 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  38.36 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  40.62 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  41.63 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 239 aa  170  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  40.72 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  40.72 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.09 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  40.72 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  40.72 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0531  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  39.29 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  38.89 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  40.72 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  45.09 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2805  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  47.16 
 
 		 321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  42.29 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 237 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 221 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 234 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  39.46 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 227 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 230 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  42.6 
 
 		 224 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 240 aa  164  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.37 
 
 		 230 aa  164  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 241 aa  164  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 245 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  42.22 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  39.74 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  42.22 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  40.43 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>