135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1888 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  761    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  55.82 
 
 		 397 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1675  protein of unknown function DUF405  50.8 
 
 		 375 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.965008  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4916  protein of unknown function DUF418  48.67 
 
 		 401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.511749  normal  0.649012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  45.84 
 
 		 401 aa  290  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1119  protein of unknown function DUF405  46.34 
 
 		 381 aa  272  8.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1646  protein of unknown function DUF405  49.6 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24980  predicted membrane protein  41.81 
 
 		 412 aa  206  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25000  predicted membrane protein  40.42 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25010  predicted membrane protein  39.31 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14550  predicted membrane protein  38.2 
 
 		 384 aa  189  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  31.19 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  27.32 
 
 		 412 aa  99.8  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  32.53 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  23.38 
 
 		 390 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  23.83 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  31.13 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  28.21 
 
 		 406 aa  93.2  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  30.75 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  28.32 
 
 		 430 aa  92  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  28.32 
 
 		 430 aa  90.1  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  25.51 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  25.69 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  24.49 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0691  hypothetical protein  29.13 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  28.4 
 
 		 417 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  31.08 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  29.13 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  25.51 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  25.51 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  29.44 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  25.64 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  27.88 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  25.81 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  25.33 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  29.32 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1492  hypothetical protein  23.69 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512867  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  25.59 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  23.62 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0666  protein of unknown function DUF405  23.39 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  26.13 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2355  protein of unknown function DUF405  28.82 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  28.64 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  29.65 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1477  hypothetical protein  24.44 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.117063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  24.44 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1593  hypothetical protein  24.44 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  29.72 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  24.44 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.19 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.037271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2752  hypothetical protein  27.44 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.915358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  28.42 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  22.56 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  24.17 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  23.69 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1942  hypothetical protein  27.43 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.235403  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  24.16 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1671  hypothetical protein  29.9 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  29.17 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1198  hypothetical protein  25.32 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  22.98 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  22.83 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  23.06 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  23.81 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  23.18 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  25.99 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2447  hypothetical protein  27.79 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02081  conserved inner membrane protein  27.53 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.452541  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1506  protein of unknown function DUF418  27.53 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.253618  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  28.77 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  28.5 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1199  hypothetical protein  22.56 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2431  hypothetical protein  27.46 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.503306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  23.21 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5203  conserved membrane spanning protein  25.95 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2286  hypothetical protein  27.79 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  24.15 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3286  hypothetical protein  27.27 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.385085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0814  hypothetical protein  27.27 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1496  hypothetical protein  27.79 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2299  hypothetical protein  27.27 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383736 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2383  hypothetical protein  27.2 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.76362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2427  hypothetical protein  27.2 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2338  hypothetical protein  27.2 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.890901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4921  hypothetical protein  21.53 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0008351  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  29.82 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  23.59 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  28.8 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4858  hypothetical protein  24.34 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  23.74 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  23.56 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  23.58 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0371  hypothetical protein  25.19 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2541  hypothetical protein  27.46 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0379465  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  29.24 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  26.82 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  27.11 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  24.2 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  29.08 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4497  membrane spanning protein  32.71 
 
 		 340 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>