More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1500 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
293 aa  581  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  0.943286 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1089  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  74.5 
 
 
298 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.58 
 
 
295 aa  334  9e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352716  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.54 
 
 
277 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
279 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
283 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.91 
 
 
299 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
278 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
278 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
275 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
276 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
273 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
283 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
275 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.45 
 
 
277 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
275 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
284 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
277 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
293 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
277 aa  175  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303025  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.18 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.29 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.47 
 
 
283 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
311 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  37.28 
 
 
283 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25430  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.47 
 
 
275 aa  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0542318  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 
291 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
299 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 
291 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
277 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.45 
 
 
278 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
280 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.326107  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
277 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.56 
 
 
281 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
289 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062951  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
285 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.87 
 
 
297 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  35.27 
 
 
278 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.290341 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  36 
 
 
278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.77 
 
 
280 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0903437  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.65 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3840  permease protein of sugar ABC transporter  40.69 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0859974  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  35.4 
 
 
280 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.652217  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.54 
 
 
283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  34.93 
 
 
275 aa  162  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
283 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03310  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
288 aa  162  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
322 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171707  normal  0.684803 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05440  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.11 
 
 
307 aa  161  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.050978  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
278 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
273 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
292 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
316 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
300 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.385749  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.25 
 
 
297 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
275 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
316 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
255 aa  159  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
305 aa  159  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
289 aa  158  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
277 aa  158  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
288 aa  158  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
308 aa  158  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408611  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
275 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
279 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.398115  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
281 aa  158  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.69 
 
 
302 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
299 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
273 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
278 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  32.87 
 
 
291 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
281 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
287 aa  156  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
273 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.1 
 
 
301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  32.18 
 
 
280 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
279 aa  155  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
277 aa  155  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.06 
 
 
280 aa  155  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>