37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2442 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  64.1 
 
 		 328 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  43.6 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  43.6 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  30.34 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  32.04 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4803  hypothetical protein  43.88 
 
 		 233 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.966948  normal  0.102625 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  33.54 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  33.54 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  33.23 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  33.68 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  31.44 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  43.55 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  43.55 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  30.19 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  37.27 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  34.25 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0365  hypothetical protein  43.55 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0396  hypothetical protein  31.4 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  32.29 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  29.82 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3346  hypothetical protein  36.21 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0421  hypothetical protein  38.71 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.504733  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4817  hypothetical protein  39.66 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.426688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  27.64 
 
 		 217 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  37.17 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4588  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1010 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200354  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1898  hypothetical protein  37.72 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.879581  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  28.7 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0116  hypothetical protein  22.58 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0870  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1040 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.185589 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3826  hypothetical protein  29.69 
 
 		 274 aa  46.2  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0594  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1043 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2693  hypothetical protein  31.18 
 
 		 251 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2600  hypothetical protein  30.11 
 
 		 251 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072147  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1263  hypothetical protein  30.11 
 
 		 244 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.214752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>