More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2293 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2293  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 359 aa  738    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  54.42 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  52.94 
 
 		 356 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  52.51 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  53.76 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  53.93 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  50.98 
 
 		 352 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  53.5 
 
 		 355 aa  362  7.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  52.51 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  52.08 
 
 		 355 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  52.23 
 
 		 355 aa  359  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  51.69 
 
 		 361 aa  358  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  51.4 
 
 		 353 aa  358  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  52.53 
 
 		 349 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  49.45 
 
 		 364 aa  355  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  52.35 
 
 		 358 aa  355  8.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.45 
 
 		 364 aa  355  8.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.18 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  51.96 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  50.42 
 
 		 355 aa  351  8.999999999999999e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  50 
 
 		 362 aa  348  6e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  50 
 
 		 352 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  49.59 
 
 		 364 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  50.98 
 
 		 353 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.31 
 
 		 356 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  50.56 
 
 		 353 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  49.32 
 
 		 364 aa  346  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.31 
 
 		 356 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.31 
 
 		 356 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  49.86 
 
 		 356 aa  345  6e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  49.86 
 
 		 356 aa  345  6e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 356 aa  345  7e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 356 aa  345  7e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 356 aa  345  7e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  48.09 
 
 		 369 aa  345  8e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  51.26 
 
 		 354 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 356 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 		 356 aa  344  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.04 
 
 		 356 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  50.28 
 
 		 357 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.2 
 
 		 356 aa  343  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.04 
 
 		 356 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  50.56 
 
 		 353 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  51.12 
 
 		 351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  50.98 
 
 		 350 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 356 aa  342  5e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  50 
 
 		 354 aa  342  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.31 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  50.14 
 
 		 355 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  49.86 
 
 		 357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  48.36 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  50.42 
 
 		 354 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  48.46 
 
 		 352 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  49.16 
 
 		 356 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  50 
 
 		 357 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0237  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.75 
 
 		 357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.35763 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  48.62 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  47.67 
 
 		 367 aa  335  5e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  48.9 
 
 		 372 aa  336  5e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  49.86 
 
 		 354 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.59 
 
 		 357 aa  335  7e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  47.92 
 
 		 356 aa  335  9e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  49.17 
 
 		 374 aa  334  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  49.45 
 
 		 357 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.73 
 
 		 379 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2712  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.76 
 
 		 363 aa  334  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.17 
 
 		 357 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.32 
 
 		 360 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  49.44 
 
 		 359 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  49.03 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  49.2 
 
 		 372 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  49.18 
 
 		 363 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.55 
 
 		 360 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  49.04 
 
 		 366 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.55 
 
 		 360 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  46.96 
 
 		 367 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.75 
 
 		 362 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  46.96 
 
 		 367 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  49.72 
 
 		 357 aa  332  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.58 
 
 		 360 aa  332  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06937  sugar ABC transportor ATP-binding protein  48.23 
 
 		 364 aa  332  8e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  48.62 
 
 		 356 aa  332  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.46 
 
 		 372 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.46 
 
 		 372 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.48 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  48.49 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  48.93 
 
 		 372 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  48.93 
 
 		 372 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  48.93 
 
 		 372 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4552  ABC transporter related  49.3 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  49.19 
 
 		 379 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  48.77 
 
 		 386 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.04 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2427  ABC transporter related  48.66 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  48.09 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.46 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  49.73 
 
 		 370 aa  330  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.46 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.48 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.46 
 
 		 372 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>