More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1172 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1172  pirin domain-containing protein  100 
 
 		 253 aa  528  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1295  hypothetical protein  78.26 
 
 		 235 aa  408  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1937  pirin domain-containing protein  42.91 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.133333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1559  pirin domain-containing protein  44.31 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1651  putative Pirin family protein  43.65 
 
 		 232 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1168  Pirin domain protein  41.73 
 
 		 233 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48650  hypothetical protein  42.35 
 
 		 232 aa  214  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4168  hypothetical protein  41.34 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0979  pirin  42.52 
 
 		 232 aa  211  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.500464  normal  0.866356 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4351  Pirin-like  42.06 
 
 		 232 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0785  Pirin-like  41.27 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.865249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4505  Pirin-like protein  41.27 
 
 		 232 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.222002 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4333  pirin domain-containing protein  42.29 
 
 		 232 aa  208  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2564  Pirin domain protein  41.73 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0980  Pirin domain protein  40.64 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1024  pirin domain-containing protein  40.71 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3304  pirin domain-containing protein  41.34 
 
 		 232 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3151  pirin domain-containing protein  41.34 
 
 		 232 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.725555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2671  Pirin-like  40.87 
 
 		 231 aa  204  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.36625  normal  0.201231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2970  pirin domain-containing protein  40.94 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496541  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3215  Pirin domain protein  39.37 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183377 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2811  pirin domain-containing protein  41.73 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.111031 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2221  pirin domain-containing protein  42.29 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1561  pirin domain-containing protein  40.16 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1316  pirin domain-containing protein  39.45 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0724579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0375  Pirin-like  40.87 
 
 		 231 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1638  Pirin-like  39.68 
 
 		 243 aa  189  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.020318  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0621  pirin domain-containing protein  41.37 
 
 		 235 aa  188  7e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000898789  normal  0.199637 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0561  Pirin-like protein  39.22 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3945  Pirin domain protein  39.83 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3095  Pirin domain protein  40.16 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000217046  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1546  hypothetical protein  40.65 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.105778  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3913  hypothetical protein  39.92 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.356203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3853  hypothetical protein  39.92 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3811  hypothetical protein  39.92 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3733  protein YhhW  39.53 
 
 		 231 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  39.61 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3847  pirin domain-containing protein  39.02 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  39.61 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4143  Pirin domain protein  39 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43440  Pirin-like, pirA  38.74 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.277134  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4093  hypothetical protein  35.43 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2575  Pirin-like  39.43 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03290  hypothetical protein  39.53 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32251  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3638  pirin family protein  39.53 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.502653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  39.53 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0274  pirin domain-containing protein  39.53 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3886  pirin family protein  39.53 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3917  pirin family protein  39.53 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  39.53 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0276  Pirin domain protein  38.74 
 
 		 231 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  37.14 
 
 		 239 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4755  pirin family protein  39.53 
 
 		 231 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3744  protein YhhW  39.53 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2564  pirin domain-containing protein  39.6 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.216137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0288  Pirin domain protein  37.04 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5011  Pirin domain protein  41.39 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.118711  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0251  Pirin domain protein  38.34 
 
 		 231 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3903  pirin domain-containing protein  36.07 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6612  pirin domain-containing protein  35.43 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.404162 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5765  Pirin-like  35.43 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0205  pirin domain-containing protein  40.73 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6130  pirin domain-containing protein  35.43 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2931  pirin domain-containing protein  38.52 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2303  pirin domain-containing protein  38.49 
 
 		 237 aa  168  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000285966  normal  0.0109374 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2559  pirin domain-containing protein  35.04 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.922785  normal  0.147332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4103  hypothetical protein  57.04 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1963  Pirin domain protein  35.69 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.210241  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5842  pirin domain-containing protein  34.92 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1210  hypothetical protein  34.96 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114398  normal  0.265926 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0133  pirin domain-containing protein  57.04 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.973345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4023  YhhW family protein  57.04 
 
 		 231 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0340  hypothetical protein  39.75 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42276 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6078  pirin domain-containing protein  34.92 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  36.89 
 
 		 233 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1852  Pirin-like  35.29 
 
 		 233 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1985  pirin domain-containing protein  37.7 
 
 		 233 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.344267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0203  Pirin domain protein  37.34 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  36.22 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47850  Pirin-like protein  34.41 
 
 		 242 aa  165  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1390  hypothetical protein  40.91 
 
 		 231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0092148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4653  pirin domain-containing protein  38.27 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000958  pirin-related protein  41.28 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5399  Pirin domain protein  35.37 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102577  normal  0.0781504 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1969  hypothetical protein  35.04 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1544  Pirin-like  38.21 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.10868  normal  0.29614 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1976  hypothetical protein  35.43 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162515  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1502  Pirin domain protein  37.3 
 
 		 233 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.231424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0585  cupin domain-containing protein  36.08 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0678  cupin domain-containing protein  36.08 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7633  Pirin-like protein  34.25 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1785  Pirin domain protein  37.3 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1955  Pirin-like  35.66 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2012  Pirin domain protein  36.22 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1067  Pirin domain protein  35.32 
 
 		 235 aa  161  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189042 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09076  possible Pirin family protein  34.25 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0380  Pirin domain protein  39.13 
 
 		 236 aa  161  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.489995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1735  pirin domain-containing protein  36.99 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2208  putative pirin-like protein  34.25 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677646  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3608  Pirin, N-terminal  37.3 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694898  normal  0.724404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>