105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0893 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0893  LrgA family protein  100 
 
 		 161 aa  318  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1047  hypothetical protein  56.41 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0885  LrgA family protein  54.4 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000433815  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3389  LrgA family protein  55.2 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0954  LrgA family protein  55.2 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0989  LrgA family protein  55.2 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0975  LrgA family protein  55.2 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0922  LrgA family protein  54.4 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3050  LrgA family protein  54.4 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119689  normal  0.0263199 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0902  LrgA family protein  56.91 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3025  LrgA family protein  51.49 
 
 		 144 aa  121  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2927  holin-like protein  49.19 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00321045  normal  0.271061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0829  LrgA family protein  52.53 
 
 		 139 aa  91.7  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  42.2 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  42.2 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  42.2 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  41.28 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  41.28 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  41.28 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  41.28 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  41.28 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  41.28 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  40.37 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  40.37 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0244  LrgA family protein  30.16 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4486  LrgA family protein  32.32 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2921  LrgA family protein  29.69 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0044  LrgA family protein  33.1 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.8296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4626  LrgA family protein  32.32 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4610  LrgA family protein  33.33 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0874041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0062  LrgA family protein  36.43 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0027  LrgA  35.66 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0043  LrgA family protein  35.66 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0899  LrgA  34.95 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4336  LrgA family protein  30.77 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616789  normal  0.455064 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3227  LrgA  34.48 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.152047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0035  LrgA family protein  31.69 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204482  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0272  LrgA family protein  35.07 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0325  hypothetical protein  29.79 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.227394  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0341  hypothetical protein  29.79 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0046  LrgA family protein  36 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3795  LrgA family protein  34.07 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4617  LrgA family protein  34.35 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4615  LrgA family protein  34.35 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.299586 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4524  LrgA family protein  34.35 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4530  LrgA family protein  34.07 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.896487  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4665  LrgA family protein  34.07 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.338361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7209  hypothetical protein  25.66 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1323  LrgA family protein  25.64 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0820  LrgA family protein  26.76 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0743787  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0421  LrgA family protein  28.28 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.712638  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4428  LrgA family protein  33.08 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.29138  normal  0.409385 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0026  LrgA family protein  35.48 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3500  LrgA family protein  34.68 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0237  LrgA family protein  33.87 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0024  LrgA family protein  37.89 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.131447  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0025  LrgA family protein  33.87 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02070  hypothetical protein  38.38 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  38.38 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2768  LrgA family protein  34.68 
 
 		 132 aa  51.2  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  38.38 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  38.38 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2288  hypothetical protein  38.38 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  38.38 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1687  hypothetical protein  34.65 
 
 		 146 aa  50.8  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172146  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00870  putative effector of murein hydrolase LrgA  31.97 
 
 		 248 aa  50.4  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  37.25 
 
 		 118 aa  50.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1606  LrgA  39.24 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1871  LrgA family protein  40 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2681  LrgA family protein  40 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  38.38 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  34.48 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  38.38 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  34.21 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2744  hypothetical protein  36.36 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2371  hypothetical protein  39.39 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2416  hypothetical protein  39.39 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2420  hypothetical protein  39.39 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2327  hypothetical protein  39.39 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2528  hypothetical protein  39.39 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2117  LrgA family protein  28.1 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00374978  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0830  hypothetical protein  37.37 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  33.62 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  33.62 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  33.62 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  26.96 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  32.67 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  29.17 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  27 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0211  LrgA family protein  24 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  42.25 
 
 		 138 aa  44.7  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  29.41 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2908  LrgA family protein  32.67 
 
 		 121 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  36.99 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0854  hypothetical protein  32.23 
 
 		 129 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  33.01 
 
 		 123 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  30 
 
 		 113 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1317  LrgA family protein  31.19 
 
 		 121 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09912e-21 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  31.37 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>