67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0110 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0110  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  100 
 
 		 243 aa  507  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0105  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  69.62 
 
 		 240 aa  339  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0068  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  65.82 
 
 		 252 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000292755 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0061  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  62.65 
 
 		 251 aa  321  8e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0783873  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4337  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  62.25 
 
 		 251 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4677  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  62.2 
 
 		 250 aa  318  7e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4282  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  61.85 
 
 		 251 aa  317  9e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676386 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4477  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  61.45 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.621367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3898  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  60.48 
 
 		 253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.217964  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3935  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  63.71 
 
 		 242 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0314402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3897  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  61.07 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3612  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  61.25 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.194342  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3706  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  57.98 
 
 		 241 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0043809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  61.89 
 
 		 250 aa  297  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238645 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3989  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  60.48 
 
 		 250 aa  293  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0101  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  55.22 
 
 		 250 aa  263  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139094 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0117  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  48.96 
 
 		 258 aa  231  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0055  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.72 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00060  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  43.66 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0330  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  42.25 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00664  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  43.66 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0241  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.92 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0182  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.92 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001809  3-deoxy-D-manno-octulosonic acid kinase  40.55 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1694  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  35.86 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2607  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  45.83 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.221231  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0015  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  43.08 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0778  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  38.67 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0850  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.98 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0306  lipopolysaccharide kinase  39.29 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1357  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.91 
 
 		 249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.232254  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1292  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  39.44 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02451  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  37.83 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2807  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  41.34 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7235 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2259  3-deoxy-D-manno-octulosonic-acid kinase  33.19 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0316  lipopolysaccharide kinase  33.66 
 
 		 272 aa  52  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0924  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1148  aminoglycoside phosphotransferase  25.84 
 
 		 269 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0705  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 219 aa  48.5  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.369661  hitchhiker  0.00000000383184 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2439  serine/threonine protein kinase  47.83 
 
 		 482 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4856  hypothetical protein  31.11 
 
 		 480 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  32.04 
 
 		 623 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5852  protein of unknown function RIO1  33 
 
 		 387 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.445195  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2329  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.107265  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0375  hypothetical protein  31.11 
 
 		 480 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578999 
 
 
-
 
NC_002950  PG0128  hypothetical protein  32.63 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0678  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 		 190 aa  47  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.458535  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0598  O-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase  24.72 
 
 		 519 aa  47  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.379748  normal  0.995378 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1369  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 209 aa  45.4  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0587  hypothetical protein  25.15 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00125956  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0825  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  26.9 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0324565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44820  lipopolysaccharide kinase  29.06 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1195  O-sialoglycoprotein endopeptidase  27.88 
 
 		 190 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.112433  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2247  O-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase  22.35 
 
 		 527 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0361  protein of unknown function RIO1  30.53 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0372  hypothetical protein  28.89 
 
 		 480 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.912848  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0347  hypothetical protein  28.89 
 
 		 480 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  30.61 
 
 		 334 aa  42.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00124  RIO1 family protein kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11730)  26.53 
 
 		 405 aa  42.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270962  normal  0.782816 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1954  O-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase  26.54 
 
 		 553 aa  42  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.22 
 
 		 716 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0966  RIO-like kinase  30.39 
 
 		 301 aa  42  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0589044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5095  serine/threonine protein kinase  33.93 
 
 		 585 aa  42  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0160466  normal  0.222813 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0279  O-sialoglycoprotein endopeptidase/protein kinase  40 
 
 		 545 aa  42  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1531  Mn2+-dependent serine/threonine protein kinase  22.03 
 
 		 206 aa  42  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000195612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2335  protein of unknown function RIO1  27.7 
 
 		 306 aa  41.6  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.0151879 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0657  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 566 aa  41.6  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>