44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1595 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0199  AAA family ATPase  35.61 
 
 
1098 aa  640    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1595  hypothetical protein  100 
 
 
1109 aa  2279    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2146  hypothetical protein  38.96 
 
 
1099 aa  731    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.174953  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2495  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  41.36 
 
 
1115 aa  806    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2992  hypothetical protein  36.44 
 
 
1098 aa  639    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296084  normal  0.329203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0686  AAA family ATPase  35.8 
 
 
1098 aa  639    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0158306  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  41.28 
 
 
1122 aa  806    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1849  hypothetical protein  37.29 
 
 
1098 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1756  hypothetical protein  40.95 
 
 
1094 aa  814    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2192  hypothetical protein  38.54 
 
 
1109 aa  778    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0639  hypothetical protein  32.99 
 
 
1137 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3011  hypothetical protein  36.16 
 
 
942 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2627  hypothetical protein  36.55 
 
 
936 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1875  hypothetical protein  34.15 
 
 
950 aa  525  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1236  hypothetical protein  33.91 
 
 
959 aa  522  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.977146  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0654  hypothetical protein  33.95 
 
 
949 aa  514  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2720  hypothetical protein  32.89 
 
 
948 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186641 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0636  hypothetical protein  32.57 
 
 
941 aa  459  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1017  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.55 
 
 
1108 aa  459  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0198  hypothetical protein  33.13 
 
 
945 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220084  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1605  AAA family ATPase  28.47 
 
 
854 aa  257  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0361  hypothetical protein  29.11 
 
 
953 aa  254  7e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3115  AAA family ATPase  27.53 
 
 
1090 aa  235  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.2402  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0237  AAA family ATPase  26.33 
 
 
865 aa  234  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316597  normal  0.106542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3985  AAA family ATPase  28.88 
 
 
932 aa  232  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.943336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4271  AAA family ATPase  26.38 
 
 
1015 aa  231  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.365445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2007  AAA family ATPase  26.19 
 
 
982 aa  215  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0508  AAA family ATPase  26.17 
 
 
924 aa  148  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00062963  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1807  hypothetical protein  25.38 
 
 
1122 aa  115  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0489397  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0015  hypothetical protein  26.44 
 
 
1050 aa  109  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195292  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2175  hypothetical protein  23.94 
 
 
1034 aa  101  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0743489  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1355  hypothetical protein  29.55 
 
 
1062 aa  97.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0274  hypothetical protein  24.47 
 
 
1037 aa  97.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1602  hypothetical protein  23.14 
 
 
1080 aa  92.8  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1394  hypothetical protein  31.88 
 
 
149 aa  79  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  31.52 
 
 
2125 aa  78.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  31.52 
 
 
2125 aa  78.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5891  AAA family ATPase  22.85 
 
 
1002 aa  72.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5491  AAA family ATPase  22.85 
 
 
1002 aa  72.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.188779 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3345  AAA family ATPase  24.83 
 
 
834 aa  67  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1310  hypothetical protein  42.86 
 
 
98 aa  62  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1776  AAA family ATPase  25.56 
 
 
814 aa  47  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.355221  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0386  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  37.97 
 
 
1068 aa  46.2  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.222582  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2758  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  38.03 
 
 
1068 aa  45.4  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>