41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0522 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
305 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.63 
 
 
298 aa  212  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.51 
 
 
284 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  34.78 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.48 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.55 
 
 
262 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.42 
 
 
262 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2506  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.35 
 
 
256 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2292  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
262 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0310197 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1018  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.27 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.746967  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.92 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1378  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.56 
 
 
260 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.42 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7169  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.6 
 
 
308 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000224117  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1565  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.18 
 
 
279 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.647267  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0034  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.89 
 
 
280 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0129877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.35 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.41 
 
 
280 aa  95.9  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.73 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  31.03 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.62 
 
 
271 aa  89.4  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2048  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.68 
 
 
274 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.47219  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30030  predicted protein  26.34 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0364402  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2176  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.95 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.57 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1397  hypothetical protein  49.38 
 
 
160 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.38 
 
 
621 aa  77.4  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.83 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06630  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2948  metal-dependent hydrolase-like  21.03 
 
 
261 aa  62.4  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.599718  normal  0.516446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.45 
 
 
635 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49245  predicted protein  23.73 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2996  hypothetical protein  26.4 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33238  conserved hypothetical protein  24.72 
 
 
388 aa  52.8  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3092  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.08 
 
 
387 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07298  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16830)  24.34 
 
 
300 aa  49.7  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0568351  normal  0.0631032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.58 
 
 
312 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.47 
 
 
340 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0181271  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7068  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.16 
 
 
1007 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332521  normal  0.746742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.76 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.72 
 
 
304 aa  42.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>