More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0052 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0052  formyl transferase domain protein  100 
 
 
182 aa  358  3e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1032  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  44.09 
 
 
187 aa  155  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2111  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  45.74 
 
 
189 aa  153  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0674  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.71 
 
 
204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0676  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.19 
 
 
204 aa  143  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1109  formyl transferase domain protein  42.08 
 
 
181 aa  137  7e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3468  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  37.76 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0524  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.1 
 
 
204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1136  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.78 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1247  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  39.29 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000481744  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2482  formyl transferase domain protein  37.57 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.712391  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1765  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.68 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.916451  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1132  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.79 
 
 
188 aa  127  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.731363  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.79 
 
 
188 aa  127  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2182  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.71 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1446  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.87 
 
 
218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1872  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.32 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1766  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.11 
 
 
193 aa  124  7e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4818  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.02 
 
 
193 aa  124  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.519157  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0657  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.36 
 
 
188 aa  122  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1701  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.63 
 
 
200 aa  122  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.489442  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0719  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.83 
 
 
193 aa  121  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.55 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301418 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2279  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.38 
 
 
200 aa  119  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1812  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.42 
 
 
202 aa  117  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1978  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.38 
 
 
200 aa  117  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0530  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  36.17 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0321  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.11 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0640594  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0810  formyl transferase domain protein  34.21 
 
 
192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3310  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.14 
 
 
195 aa  114  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_6266  predicted protein  30.93 
 
 
206 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00248936  normal  0.275546 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2363  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.38 
 
 
203 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0431  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.22 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0218  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.16 
 
 
206 aa  112  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0482  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  35.79 
 
 
313 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0319  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.98 
 
 
232 aa  111  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.0027967  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.85 
 
 
202 aa  111  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0643  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.36 
 
 
217 aa  111  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1295  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.76 
 
 
204 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.295392  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1456  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.93 
 
 
209 aa  110  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.551821 
 
 
-
 
NC_002978  WD0763  phosphoribosylglycinamide formyltransferase, putative  34.41 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211527  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2324  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.73 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0284  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0269  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0272  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0504  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.69 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0297  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0329  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1738  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.41 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0370  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.33 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1292  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.29 
 
 
218 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000519718  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1259  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.04 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.582521  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09921  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.98 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.337887 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1523  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.7 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1572  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.7 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0326  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.31 
 
 
195 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2722  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.35 
 
 
216 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.826865  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0262  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.38 
 
 
194 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0388  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.95 
 
 
185 aa  108  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4977  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.82 
 
 
195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1094  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.53 
 
 
223 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.538676  hitchhiker  0.0026309 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1574  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.26 
 
 
229 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1417  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.51 
 
 
205 aa  107  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000602325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1138  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.16 
 
 
210 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0278  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.79 
 
 
195 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3197  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.09 
 
 
213 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000983298  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0028  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.76 
 
 
182 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1759  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.69 
 
 
214 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1632  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.75 
 
 
216 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0554809 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0343  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.82 
 
 
195 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0791  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.6 
 
 
220 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277928  normal  0.560587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2333  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.35 
 
 
216 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  0.274367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2878  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.9 
 
 
220 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2154  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.46 
 
 
206 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000463189  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0764  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.05 
 
 
203 aa  106  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3067  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.89 
 
 
196 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2666  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.75 
 
 
213 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03155  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  42.5 
 
 
130 aa  105  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1630  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  33.85 
 
 
214 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1674  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.24 
 
 
203 aa  105  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.867032  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1130  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  34.03 
 
 
195 aa  104  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861334  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0711  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.5 
 
 
222 aa  104  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1240  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30 
 
 
223 aa  104  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000502279 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2741  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  28.87 
 
 
221 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280146  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3332  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.57 
 
 
214 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.131556 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2454  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.84 
 
 
216 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1020  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.26 
 
 
197 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2381  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.21 
 
 
214 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0156868  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2453  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.21 
 
 
214 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0349529  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1778  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  38.46 
 
 
192 aa  102  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2317  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.61 
 
 
220 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.205766  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2546  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.21 
 
 
214 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000131759  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1773  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.22 
 
 
206 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000352591  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2219  formyl transferase domain protein  34.91 
 
 
317 aa  102  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.46256  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2045  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  31.94 
 
 
205 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.400719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2403  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  29.63 
 
 
204 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1595  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  30.21 
 
 
214 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000272068  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0945  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.34 
 
 
220 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4565  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  27.32 
 
 
222 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0522  formyl transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
187 aa  102  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.220861  normal  0.682317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>