More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6280 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6280  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  200  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0596965  normal  0.273868 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4281  hypothetical protein  54.74 
 
 		 112 aa  117  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  59.04 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0255  hypothetical protein  53.66 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.45321  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0231  hypothetical protein  53.66 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4378  hypothetical protein  52.44 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1214  hypothetical protein  47.19 
 
 		 100 aa  88.2  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.595392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1191  hypothetical protein  45.98 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.945975  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  43.02 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  43.16 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  40.7 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  48.28 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  44.19 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  46.25 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  46.43 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  44.44 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2441  hypothetical protein  41.3 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  51.25 
 
 		 107 aa  76.6  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1895  FeS assembly SUF system protein  40.22 
 
 		 126 aa  76.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166707  hitchhiker  0.00465404 
 
 
-
 
NC_004310  BR0935  hypothetical protein  43.21 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.861252  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2102  FeS assembly SUF system protein  40.22 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0929  FeS assembly SUF system protein  43.21 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1220  serine O-acetyltransferase  53.16 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  40.7 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  43.18 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  40.7 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  43.02 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  41.05 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  41.86 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1464  FeS assembly SUF system protein  40.22 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26453  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  45.68 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  46.25 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1320  hypothetical protein  43.48 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0203207  normal  0.743383 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  48.75 
 
 		 238 aa  74.7  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  43.33 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  44.57 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  42.22 
 
 		 111 aa  73.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2251  FeS assembly SUF system protein  41.98 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.908211  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0327  hypothetical protein  41.94 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  39.77 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  38.64 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  45.24 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  41.38 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1375  YitW  46.43 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000417964  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  38.64 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  40.91 
 
 		 99 aa  72  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0766  hypothetical protein  43.02 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.36517  normal  0.611735 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1777  hypothetical protein  40.22 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.716432  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0140  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  37.63 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.470209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  46.51 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0985  protein of unknown function DUF59  39.33 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0278176  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  39.29 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1842  YitW  44.05 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0133153  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  38.37 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  39.33 
 
 		 113 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  48.35 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  39.08 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  39.56 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  45.35 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  38.89 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4465  FeS assembly SUF system protein  38.89 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  39.02 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  41.67 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  36.67 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  41.86 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  38.89 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  40 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1749  hypothetical protein  34.88 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0711062  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2027  FeS assembly SUF system protein  40.7 
 
 		 113 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0908  hypothetical protein  41.57 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  35.56 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  39.56 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  38.04 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2348  hypothetical protein  40.7 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.537169 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  35.79 
 
 		 108 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4171  FeS assembly SUF system protein SufT  39.78 
 
 		 185 aa  67  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2033  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  40.66 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  35.87 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  39.53 
 
 		 108 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0172  hypothetical protein  34.88 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0339  protein of unknown function DUF59  38.1 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  41.77 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0795  hypothetical protein  36.9 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  40.21 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0351  protein of unknown function DUF59  38.1 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  37.8 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4461  FeS assembly SUF system protein  39.51 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.148381 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0453  serine O-acetyltransferase  44.83 
 
 		 315 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  39.76 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2569  hypothetical protein  38.37 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0345  hypothetical protein  39.53 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3156  hypothetical protein  37.11 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0127  hypothetical protein  34.78 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  39.08 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0848  hypothetical protein  41.57 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.898331  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  40.21 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3077  hypothetical protein  36.05 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.214528  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  40.48 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  36.78 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3304  hypothetical protein  36.05 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>