More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5704 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5704  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 146 aa  304  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7090  3-dehydroquinate dehydratase  59.31 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5950  3-dehydroquinate dehydratase  58.7 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375239  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.55 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 147 aa  159  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 147 aa  159  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  54.23 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 		 193 aa  158  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 151 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 151 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 151 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 151 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 193 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 193 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 193 aa  155  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  55.22 
 
 		 158 aa  155  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4106  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 151 aa  151  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  56.55 
 
 		 147 aa  150  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 148 aa  148  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 		 146 aa  147  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 146 aa  147  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 153 aa  146  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.47 
 
 		 142 aa  146  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  53.38 
 
 		 154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 		 148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 157 aa  144  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 176 aa  144  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  51.02 
 
 		 152 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 		 147 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 176 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  50.72 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 		 143 aa  144  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 152 aa  144  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3150  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.21 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 152 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1000  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.47 
 
 		 146 aa  141  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.178462  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  53.62 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  49.64 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2396  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780145  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2355  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.547527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2402  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0545033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 177 aa  140  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 148 aa  139  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2054  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 151 aa  139  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  51.49 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 148 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.35 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  47.48 
 
 		 145 aa  137  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.96 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 		 145 aa  137  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  46.94 
 
 		 159 aa  136  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  53.33 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  46.72 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  49.31 
 
 		 146 aa  134  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  51.91 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  53.42 
 
 		 151 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 150 aa  133  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2570  3-dehydroquinate dehydratase  48.2 
 
 		 151 aa  133  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0715  3-dehydroquinate dehydratase  53.42 
 
 		 148 aa  133  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.08 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 		 156 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  51.05 
 
 		 163 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2950  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.62 
 
 		 149 aa  131  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000135436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>