More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5336 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  68.66 
 
 		 509 aa  672    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6358  ABC transporter related  77.06 
 
 		 507 aa  765    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.189938  normal  0.105894 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6179  ABC transporter related  77.84 
 
 		 510 aa  778    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0516562  normal  0.382229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5272  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  78.15 
 
 		 506 aa  766    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5336  ABC transporter related  100 
 
 		 508 aa  1000    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1303  ABC transporter related  61.72 
 
 		 506 aa  576  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  54.55 
 
 		 514 aa  492  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  53.6 
 
 		 509 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2785  ABC transporter component  56.97 
 
 		 511 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  53.89 
 
 		 530 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0344  putative ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  56.36 
 
 		 506 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1988  ABC transporter related  56.36 
 
 		 506 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.460194 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0952  ABC transporter related  56.16 
 
 		 506 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111594  normal  0.315399 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3576  ABC transporter-related protein  53.47 
 
 		 550 aa  463  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.993778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3190  ABC transporter related  53.83 
 
 		 514 aa  458  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.974403  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2658  ABC transporter related  52.53 
 
 		 534 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00395214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4427  ABC transporter related  49.33 
 
 		 567 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348949  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  42.89 
 
 		 509 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  42.86 
 
 		 503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 		 511 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.51 
 
 		 511 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  44.05 
 
 		 509 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  45.78 
 
 		 525 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  44.18 
 
 		 508 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  46.41 
 
 		 541 aa  396  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  45.4 
 
 		 505 aa  393  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0860  ABC transporter related  44.25 
 
 		 511 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  45.09 
 
 		 527 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  43.6 
 
 		 551 aa  389  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  41.75 
 
 		 511 aa  391  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  47.69 
 
 		 518 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  42.52 
 
 		 514 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 		 507 aa  386  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0633  ABC transporter related  43.37 
 
 		 518 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000912545 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  41.97 
 
 		 513 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  42.23 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 		 510 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 		 510 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 510 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 		 510 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.8 
 
 		 510 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 510 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  42.25 
 
 		 502 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  45.62 
 
 		 534 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  40.67 
 
 		 510 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.8 
 
 		 508 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 		 510 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 		 510 aa  379  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.2 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  45.94 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2210  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  46.02 
 
 		 525 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1076  ABC transporter related  38.29 
 
 		 515 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0403178  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  46.11 
 
 		 527 aa  375  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  45.16 
 
 		 524 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  41.32 
 
 		 510 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0885  ABC transporter related  45.74 
 
 		 525 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317541  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  42.74 
 
 		 491 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  42.77 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  44 
 
 		 548 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  43.28 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  44.02 
 
 		 533 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  44.16 
 
 		 511 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  46.08 
 
 		 534 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  40.64 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  40.52 
 
 		 520 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  46.06 
 
 		 604 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.52 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  46.11 
 
 		 551 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  43.82 
 
 		 503 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1446  ABC transporter-related protein  43.23 
 
 		 514 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  43.63 
 
 		 503 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  44.27 
 
 		 515 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  42.28 
 
 		 517 aa  367  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  41.47 
 
 		 518 aa  365  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2283  ABC transporter related  44.44 
 
 		 525 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.693336 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  40.92 
 
 		 510 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0726  ABC transporter related  42.13 
 
 		 538 aa  365  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1298  ABC transporter ATP-binding protein  42.52 
 
 		 523 aa  365  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  43.71 
 
 		 511 aa  364  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  41.28 
 
 		 510 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  39.2 
 
 		 507 aa  363  3e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6738  ABC transporter related protein  41.91 
 
 		 532 aa  363  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  44.53 
 
 		 506 aa  363  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3151  ABC transporter related  44.05 
 
 		 533 aa  363  5.0000000000000005e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  42.16 
 
 		 524 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  39.41 
 
 		 528 aa  363  6e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  43.75 
 
 		 534 aa  361  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  40.24 
 
 		 509 aa  362  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0922  ATPase  45.05 
 
 		 502 aa  361  2e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.213196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  39.33 
 
 		 521 aa  361  2e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  41.6 
 
 		 527 aa  360  4e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3586  ABC transporter ATP-binding protein  41.26 
 
 		 529 aa  359  6e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3673  ABC transporter related  39.44 
 
 		 491 aa  359  6e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.04 
 
 		 528 aa  359  6e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  42.42 
 
 		 545 aa  359  8e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  42.71 
 
 		 514 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  44.18 
 
 		 505 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.33 
 
 		 512 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  39.64 
 
 		 507 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  43.89 
 
 		 558 aa  357  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>