More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4259 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4259  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  437  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  82.27 
 
 		 225 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  82.27 
 
 		 225 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  79.64 
 
 		 226 aa  360  7.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0310  two component transcriptional regulator  80.36 
 
 		 223 aa  330  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  51.8 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  51.8 
 
 		 247 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  52.27 
 
 		 291 aa  215  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  51.8 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  51.8 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  51.8 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  51.8 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  51.8 
 
 		 223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  51.82 
 
 		 253 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 273 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  51.34 
 
 		 266 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.82 
 
 		 260 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.88 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.58 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 223 aa  204  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 224 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 236 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.18 
 
 		 223 aa  201  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 235 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02407  two-component system regulatory protein  50.45 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3934  DNA-binding response regulator  47.09 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 223 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 221 aa  198  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 224 aa  198  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  47.75 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.09 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 224 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0286  response regulator receiver protein  49.32 
 
 		 231 aa  194  6e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.27 
 
 		 225 aa  194  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  47.3 
 
 		 224 aa  192  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  45.66 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  47.03 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  47.03 
 
 		 287 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  47.03 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  47.03 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  47.03 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  47.03 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49450  response regulator TctD  46.58 
 
 		 223 aa  191  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.537816  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  46.82 
 
 		 219 aa  191  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3958  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.92 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6140  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0752147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.91 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  46.58 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2101  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4036  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1459  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0496  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.569564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0057  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 225 aa  187  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 223 aa  187  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3585  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3281  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.04 
 
 		 226 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3603  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.04 
 
 		 226 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3392  response regulator transcription regulator protein  44.5 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 221 aa  185  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2264  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 221 aa  184  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.664043  normal  0.0314152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 219 aa  184  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  45.29 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3169  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.121131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3437  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  44.84 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>