59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3877 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3877  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  403  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5575  protein of unknown function DUF1003  58.33 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0848  protein of unknown function DUF1003  51.55 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1875  hypothetical protein  50.28 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1803  hypothetical protein  50.96 
 
 		 188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  0.502953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2139  protein of unknown function DUF1003  50.96 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.210739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4151  protein of unknown function DUF1003  44.25 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1755  protein of unknown function DUF1003  49.04 
 
 		 188 aa  158  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1548  hypothetical protein  49.68 
 
 		 190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3227  hypothetical protein  52.33 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2219  protein of unknown function DUF1003  52.53 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1949  hypothetical protein  39.76 
 
 		 174 aa  126  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0465515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0189  hypothetical protein  41.14 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0838572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  52.08 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1964  hypothetical protein  36.65 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3961  membrane protein-like  38.18 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.201378  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  31.11 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  31.45 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  31.45 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2867  protein of unknown function DUF1003  30.41 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000997014  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  37.36 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  33.98 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  35.79 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1649  hypothetical protein  37.25 
 
 		 235 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0020  hypothetical protein  37.25 
 
 		 235 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  34.86 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3017  hypothetical protein  30.19 
 
 		 301 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3206  protein of unknown function DUF1003  29.25 
 
 		 286 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  27.22 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  34.38 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  32.52 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3902  hypothetical protein  31.97 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0121  protein of unknown function DUF1003  31.17 
 
 		 167 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0716  hypothetical protein  32.47 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0663  hypothetical protein  32.47 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.946103  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  32.99 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4500  protein of unknown function DUF1003  29.67 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8409  membrane protein-like protein  28.97 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.381654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  32.05 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1680  protein of unknown function DUF1003  33.78 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000539657  normal  0.503205 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  27.88 
 
 		 246 aa  45.8  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2595  membrane protein-like protein  26.17 
 
 		 174 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0902  hypothetical protein  24.53 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  28.57 
 
 		 176 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27840  predicted membrane protein  26.67 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0665  hypothetical protein  30.26 
 
 		 348 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965403  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3816  hypothetical protein  28.28 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal  0.183885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1133  protein of unknown function DUF1003  29 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4309  hypothetical protein  28.75 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1189  protein of unknown function DUF1003  26.47 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0470959  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  30.93 
 
 		 286 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15340  predicted membrane protein  24.71 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0445  hypothetical protein  30.93 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.866807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0765  protein of unknown function DUF1003  27.33 
 
 		 168 aa  42.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2207  hypothetical protein  28.21 
 
 		 181 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3010  hypothetical protein  26.55 
 
 		 156 aa  42  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.532145 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0700  protein of unknown function DUF1003  27.35 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.496002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2484  protein of unknown function DUF1003  25.35 
 
 		 175 aa  41.6  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.894398  normal  0.0500365 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  24.44 
 
 		 293 aa  41.2  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>