More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0117 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  625  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0176  protein of unknown function DUF344  75.87 
 
 		 293 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0345368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0166  protein of unknown function DUF344  74.48 
 
 		 293 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.134346 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0497  hypothetical protein  68.17 
 
 		 294 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  63.54 
 
 		 299 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0297  hypothetical protein  64.73 
 
 		 319 aa  381  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0310  hypothetical protein  64.73 
 
 		 319 aa  381  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0380  hypothetical protein  65.05 
 
 		 314 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1910  hypothetical protein  56.13 
 
 		 324 aa  316  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  57.89 
 
 		 263 aa  314  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  57.96 
 
 		 326 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  57.96 
 
 		 364 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  57.14 
 
 		 331 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  56.45 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1846  hypothetical protein  55.82 
 
 		 297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.259888  normal  0.104135 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2425  hypothetical protein  51.55 
 
 		 340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832144  normal  0.152197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  49.01 
 
 		 405 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01730  hypothetical protein  56.5 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0103063  normal  0.483581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  56.33 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  53.87 
 
 		 365 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0766  hypothetical protein  55.16 
 
 		 336 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.08603  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0141  hypothetical protein  55.65 
 
 		 393 aa  299  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  55.47 
 
 		 303 aa  299  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  54.69 
 
 		 369 aa  299  4e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3838  protein of unknown function DUF344  54.18 
 
 		 310 aa  299  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0409  hypothetical protein  53.97 
 
 		 338 aa  298  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  49.64 
 
 		 314 aa  298  6e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  53.39 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  56.33 
 
 		 375 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1835  hypothetical protein  50.17 
 
 		 340 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  54.69 
 
 		 391 aa  296  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  53.85 
 
 		 329 aa  295  7e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  52.67 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3681  protein of unknown function DUF344  52.78 
 
 		 311 aa  293  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.153491  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09420  hypothetical protein  52.04 
 
 		 304 aa  292  4e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  51.42 
 
 		 301 aa  292  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  54.18 
 
 		 289 aa  291  8e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  53.66 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  54.1 
 
 		 294 aa  290  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03430  hypothetical protein  54.51 
 
 		 314 aa  288  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0906844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  54.29 
 
 		 367 aa  286  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  53.88 
 
 		 383 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0434  hypothetical protein  54.2 
 
 		 372 aa  285  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3195  hypothetical protein  50.37 
 
 		 309 aa  285  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0203671  normal  0.0145354 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0123  protein of unknown function DUF344  51.5 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0172  protein of unknown function DUF344  52.21 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0791  hypothetical protein  53.47 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0796  hypothetical protein  53.47 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0811  hypothetical protein  53.47 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.242825  normal  0.0896484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  50.2 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  50.54 
 
 		 327 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3897  protein of unknown function DUF344  52.23 
 
 		 299 aa  278  9e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000198104  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0707  hypothetical protein  50.82 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0146  hypothetical protein  55.56 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  49.64 
 
 		 289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  53.68 
 
 		 256 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  50.83 
 
 		 293 aa  271  1e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  55.41 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1088  PvdS  50.63 
 
 		 276 aa  269  4e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19510  hypothetical protein  51.22 
 
 		 296 aa  268  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.150154  normal  0.0265241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2784  hypothetical protein  51.48 
 
 		 269 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.36222  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  52.42 
 
 		 295 aa  266  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  54.22 
 
 		 276 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1884  hypothetical protein  50.85 
 
 		 284 aa  266  4e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  49.05 
 
 		 337 aa  264  1e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  51.46 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1708  protein of unknown function DUF344  51.79 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000362162  normal  0.0572402 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0273  hypothetical protein  49.81 
 
 		 307 aa  263  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.327592 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  51.19 
 
 		 307 aa  263  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  51.75 
 
 		 292 aa  262  6e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004376  hypothetical protein  54.13 
 
 		 258 aa  261  8e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.106116  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  51.57 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3594  hypothetical protein  49.22 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.894473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4069  hypothetical protein  47.83 
 
 		 316 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00361553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2168  hypothetical protein  49.62 
 
 		 294 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.219464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  51 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  52.72 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2560  hypothetical protein  49.03 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  49.62 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  52 
 
 		 318 aa  259  4e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2825  hypothetical protein  52.54 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04552  transcriptional regulator  53.18 
 
 		 260 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.552506  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3567  protein of unknown function DUF344  50.97 
 
 		 300 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1700  protein of unknown function DUF344  51.75 
 
 		 286 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5312  protein of unknown function DUF344  51.75 
 
 		 286 aa  258  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0163958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  52.34 
 
 		 304 aa  258  8e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2997  hypothetical protein  52.34 
 
 		 304 aa  258  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628972  normal  0.723362 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1642  hypothetical protein  49.6 
 
 		 294 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.263612  normal  0.391802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4304  protein of unknown function DUF344  47.88 
 
 		 308 aa  258  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0972  protein of unknown function DUF344  49.17 
 
 		 265 aa  257  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0632  hypothetical protein  49 
 
 		 308 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0780387  normal  0.0234683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33240  hypothetical protein  52.12 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.476246  normal  0.0402084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4413  hypothetical protein  49.41 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  48.26 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  48.47 
 
 		 310 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6349  protein of unknown function DUF344  50.8 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0013  hypothetical protein  49.21 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.501718  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0550  hypothetical protein  51.48 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1274  hypothetical protein  54.59 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3148  hypothetical protein  54.59 
 
 		 305 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>