265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_4002 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_4002  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
259 aa  498  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.870247  normal  0.121149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1901  hypothetical protein  59.51 
 
 
276 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000112667  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3933  hypothetical protein  58.17 
 
 
253 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000513433  normal  0.0196237 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  58.17 
 
 
253 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3567  hypothetical protein  58.57 
 
 
253 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000059782  normal  0.277747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  51.01 
 
 
252 aa  231  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3337  hypothetical protein  51.44 
 
 
252 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4088  protein of unknown function DUF81  52.8 
 
 
256 aa  229  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  51.42 
 
 
252 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0242  protein of unknown function DUF81  50.41 
 
 
252 aa  226  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0248  hypothetical protein  50.41 
 
 
252 aa  226  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  51.88 
 
 
253 aa  226  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0361  hypothetical protein  50 
 
 
252 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0479  hypothetical protein  55.23 
 
 
251 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0304  hypothetical protein  50.41 
 
 
252 aa  222  6e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  49.37 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3206  protein of unknown function DUF81  51.82 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0189  hypothetical protein  52.5 
 
 
253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0014  hypothetical protein  48.97 
 
 
263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3919  hypothetical protein  50.2 
 
 
252 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3365  hypothetical protein  54.47 
 
 
253 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3514  hypothetical protein  50.64 
 
 
252 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0832  hypothetical protein  46 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1064  protein of unknown function DUF81  45.6 
 
 
254 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0315  protein of unknown function DUF81  47.7 
 
 
252 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  42.46 
 
 
264 aa  188  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1168  hypothetical protein  44.58 
 
 
254 aa  188  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00022573  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  44.58 
 
 
254 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1590  protein of unknown function DUF81  43.75 
 
 
286 aa  174  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2925  hypothetical protein  41.39 
 
 
255 aa  168  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.757081  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11410  predicted permease  43.53 
 
 
262 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00603375  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15620  predicted permease  42.15 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1577  protein of unknown function DUF81  42.49 
 
 
255 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4082  protein of unknown function DUF81  39.5 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0842  hypothetical protein  36.86 
 
 
255 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000149999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1113  hypothetical protein  37.25 
 
 
255 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.172741  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0985  hypothetical protein  36.86 
 
 
255 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0854  hypothetical protein  36.47 
 
 
255 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0046251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0886  hypothetical protein  36.08 
 
 
255 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430997  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0939  hypothetical protein  36.08 
 
 
255 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0278  protein of unknown function DUF81  42.41 
 
 
258 aa  156  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5401  hypothetical protein  38.71 
 
 
252 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0907707  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  42.28 
 
 
264 aa  155  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  37.65 
 
 
250 aa  154  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4327  hypothetical protein  36.86 
 
 
255 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.876554 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1026  hypothetical protein  36.86 
 
 
255 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4288400000000001e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1030  hypothetical protein  36.47 
 
 
255 aa  152  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0834  hypothetical protein  36.86 
 
 
255 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  36.08 
 
 
256 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2093  protein of unknown function DUF81  38.02 
 
 
256 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  36.65 
 
 
256 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  36.08 
 
 
256 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  36.65 
 
 
256 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  36.65 
 
 
256 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  36.65 
 
 
256 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  36.25 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1278  hypothetical protein  35.63 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0121566  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  34.65 
 
 
256 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  34.38 
 
 
251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  34.65 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0288  hypothetical protein  37.05 
 
 
256 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1805  hypothetical protein  35.12 
 
 
256 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1788  protein of unknown function DUF81  36.92 
 
 
279 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00173332  normal  0.905641 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1770  hypothetical protein  35.12 
 
 
256 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  36.58 
 
 
256 aa  142  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0189  hypothetical protein  34.01 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  33.86 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1028  protein of unknown function DUF81  40.86 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2578  hypothetical protein  40.18 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  33.88 
 
 
253 aa  139  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1793  hypothetical protein  39.53 
 
 
254 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.607565  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  36.03 
 
 
261 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  31.76 
 
 
252 aa  137  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  36.03 
 
 
272 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1208  protein of unknown function DUF81  39.24 
 
 
267 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06970  predicted permease  41.67 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0497367  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0842  hypothetical protein  38.11 
 
 
262 aa  135  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.213592 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  33.99 
 
 
259 aa  135  8e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  33.33 
 
 
253 aa  135  9e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  35.66 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0553  protein of unknown function DUF81  41.28 
 
 
261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  35.66 
 
 
255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2563  protein of unknown function DUF81  32.93 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.756346  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0487  hypothetical protein  36.33 
 
 
265 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  37.04 
 
 
253 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2209  protein of unknown function DUF81  39.44 
 
 
255 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000506184 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1025  protein of unknown function DUF81  41.63 
 
 
254 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.665306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  34.48 
 
 
281 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  36.48 
 
 
265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  35.41 
 
 
259 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  32.42 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  32.42 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40940  hypothetical protein  35.41 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  33.2 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  34.29 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0959  hypothetical protein  41.86 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.170118  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0274  hypothetical protein  33.2 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  32.42 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  33.2 
 
 
254 aa  130  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  34.29 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>