43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1734 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  43.93 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  36.31 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  33.14 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  32.95 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  36.11 
 
 		 199 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  32.6 
 
 		 198 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  33.89 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60810  putative transcriptional regulator NfxB  32.94 
 
 		 172 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  32.53 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  34.09 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  32.02 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5237  transcriptional regulator NfxB  30.6 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  30.48 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 207 aa  51.6  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  24.68 
 
 		 204 aa  51.2  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 232 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 209 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 184 aa  44.7  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  51.16 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 224 aa  41.2  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>