More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4776 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4776  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 355 aa  729    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.437882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1609  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  66.96 
 
 		 349 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00228906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  43.71 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  42.95 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  40.26 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  38.31 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  39.94 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  39.94 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  40.26 
 
 		 307 aa  215  9e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  40.98 
 
 		 302 aa  212  9e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  38.19 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  40.65 
 
 		 311 aa  209  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  38.08 
 
 		 298 aa  209  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  42.81 
 
 		 301 aa  209  8e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  39.14 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  41.06 
 
 		 320 aa  206  5e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  40.73 
 
 		 320 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  41.91 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  39.48 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  38.36 
 
 		 301 aa  204  3e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  37.74 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  41.16 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  42.12 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  40.39 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  38.03 
 
 		 321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  41.83 
 
 		 311 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  38.94 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  40.51 
 
 		 310 aa  199  7e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  39.2 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  41.39 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  40.85 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  40.07 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  39.29 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  40.45 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  39.6 
 
 		 320 aa  196  7e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  40.51 
 
 		 310 aa  196  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  39.8 
 
 		 299 aa  195  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  39.22 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  40.78 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  41.64 
 
 		 300 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  38.91 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  40.66 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  38.69 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  40.07 
 
 		 307 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0955  cysteine synthase A  43.46 
 
 		 305 aa  193  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  39.14 
 
 		 305 aa  193  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1301  cysteine synthase A  41.29 
 
 		 309 aa  193  4e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.568697 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  40.66 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  40.67 
 
 		 291 aa  192  8e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  40.91 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  39.02 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  37.62 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1557  cysteine synthase  36.06 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  40.33 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  39.67 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  36.07 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  36.93 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1919  cysteine synthase A  40.13 
 
 		 305 aa  190  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468327  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  39.09 
 
 		 306 aa  190  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  40.13 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  40.85 
 
 		 311 aa  189  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  40.26 
 
 		 317 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  38.08 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  40.63 
 
 		 317 aa  189  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  39.41 
 
 		 305 aa  189  9e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  40.13 
 
 		 305 aa  189  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  39.94 
 
 		 308 aa  189  9e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  38.83 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  39.8 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  40.4 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  40.46 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  37.99 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  35.74 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  37.05 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  36.72 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  36.72 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  36.18 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  38.96 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  37.7 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2316  cysteine synthase  35.05 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  37.42 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  39.8 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1632  cysteine synthase A  35.35 
 
 		 349 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1697  cysteine synthase A  39.47 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.516314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1831  cysteine synthase A  39.47 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  40.07 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  39.8 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  39.56 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  39.47 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  39.47 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  40.13 
 
 		 327 aa  186  7e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  38.49 
 
 		 305 aa  186  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  37.66 
 
 		 328 aa  185  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  39.14 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  37.13 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  40.2 
 
 		 308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  39.67 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  39.87 
 
 		 308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94354  predicted protein  35.58 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.25713  hitchhiker  0.00194835 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  39.94 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>