More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4596 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4596  transposase IS4 family protein  100 
 
 
184 aa  384  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3747  transposase IS4 family protein  56.11 
 
 
253 aa  222  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6992  transposase IS4 family protein  56.67 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593642  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4850  transposase IS4 family protein  64.18 
 
 
278 aa  191  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.273461  normal  0.675406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  40.94 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4011  transposase IS4 family protein  40.94 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000062749  hitchhiker  0.0000247291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4446  transposase IS4 family protein  40.94 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39932  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  40.94 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0651195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5329  transposase IS4 family protein  40.94 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0475309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  40.94 
 
 
275 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  40.48 
 
 
271 aa  121  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  40.7 
 
 
280 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  41.04 
 
 
270 aa  118  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 
274 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  41.62 
 
 
274 aa  117  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  39.18 
 
 
308 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  41.62 
 
 
274 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  39.41 
 
 
275 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  41.04 
 
 
274 aa  114  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  41.04 
 
 
274 aa  114  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  41.04 
 
 
274 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  37.99 
 
 
275 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  39.73 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  39.73 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  39.73 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  39.73 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  39.73 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  39.73 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  39.73 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  39.73 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  37.91 
 
 
274 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  40.46 
 
 
274 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  39.41 
 
 
278 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  39.41 
 
 
278 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  38.24 
 
 
276 aa  109  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  39.41 
 
 
278 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  39.41 
 
 
278 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  39.41 
 
 
278 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  39.41 
 
 
278 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  39.41 
 
 
278 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  39.41 
 
 
278 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  39.41 
 
 
278 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  39.41 
 
 
278 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  39.41 
 
 
278 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  39.41 
 
 
278 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  37.06 
 
 
270 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  37.06 
 
 
276 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  37.06 
 
 
270 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  42.95 
 
 
274 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1708  transposase IS4 family protein  37.14 
 
 
273 aa  104  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  34.3 
 
 
265 aa  104  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  38.36 
 
 
268 aa  104  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  37.67 
 
 
268 aa  104  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  39.04 
 
 
270 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  43.54 
 
 
274 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  38.73 
 
 
274 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  35.47 
 
 
274 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  35.47 
 
 
274 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  35.47 
 
 
274 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  35.47 
 
 
274 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  33.14 
 
 
265 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  35.19 
 
 
283 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  42.5 
 
 
224 aa  102  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  35.47 
 
 
274 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  35.47 
 
 
274 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  35.26 
 
 
295 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  35.26 
 
 
295 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  35.26 
 
 
295 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  35.47 
 
 
280 aa  101  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  36 
 
 
294 aa  101  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  42.97 
 
 
254 aa  100  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  43.2 
 
 
251 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  32.98 
 
 
284 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  32.98 
 
 
284 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  32.98 
 
 
279 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0457  insertion element transposase  34.57 
 
 
222 aa  98.6  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  35.88 
 
 
273 aa  98.6  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  35.88 
 
 
273 aa  98.6  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  34.3 
 
 
274 aa  98.6  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1298  transposase IS4 family protein  33.72 
 
 
269 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0151  transposase, IS4  37.43 
 
 
250 aa  97.8  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  33.5 
 
 
293 aa  97.1  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  31.4 
 
 
274 aa  96.3  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  31.4 
 
 
274 aa  95.9  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  31.4 
 
 
274 aa  95.5  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  31.4 
 
 
274 aa  95.9  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>