More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4850 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4850  transposase IS4 family protein  100 
 
 
278 aa  580  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.273461  normal  0.675406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3747  transposase IS4 family protein  68.93 
 
 
253 aa  271  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6992  transposase IS4 family protein  64.97 
 
 
259 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.593642  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4596  transposase IS4 family protein  64.18 
 
 
184 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4446  transposase IS4 family protein  44.69 
 
 
251 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39932  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  44.69 
 
 
251 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0651195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  44.69 
 
 
251 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5329  transposase IS4 family protein  44.69 
 
 
251 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0475309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4011  transposase IS4 family protein  44.69 
 
 
251 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000062749  hitchhiker  0.0000247291 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  41.84 
 
 
271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  40.78 
 
 
308 aa  122  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  41.01 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  40.56 
 
 
275 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  41.01 
 
 
224 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  41.34 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  42.13 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  41.01 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  41.01 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  41.01 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  41.01 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  41.01 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  41.01 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  41.01 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  41.01 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  39.33 
 
 
274 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  40.45 
 
 
274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  38.76 
 
 
274 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  39.33 
 
 
274 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 
295 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 
295 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  38.12 
 
 
295 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  38.76 
 
 
268 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  38.2 
 
 
274 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  38.76 
 
 
274 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1708  transposase IS4 family protein  39.49 
 
 
273 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  38.76 
 
 
274 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  39.33 
 
 
268 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1109  transposase, IS4  40.12 
 
 
278 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138434  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2037  transposase, IS4  40.12 
 
 
278 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362395  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2540  transposase, IS4  40.12 
 
 
278 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2707  transposase, IS4  40.12 
 
 
278 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3998  transposase, IS4  40.12 
 
 
237 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4006  transposase, IS4  40.12 
 
 
278 aa  106  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  37.85 
 
 
274 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2080  transposase, IS4  40.12 
 
 
278 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.382451  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  39.89 
 
 
278 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  39.89 
 
 
278 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  39.89 
 
 
278 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  39.89 
 
 
278 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  39.89 
 
 
278 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  39.89 
 
 
278 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  39.89 
 
 
278 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  39.89 
 
 
278 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  39.89 
 
 
278 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  39.89 
 
 
278 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  39.89 
 
 
278 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  39.89 
 
 
278 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  39.33 
 
 
273 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  39.33 
 
 
273 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  34.38 
 
 
287 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  34.38 
 
 
287 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  34.38 
 
 
287 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  38.2 
 
 
274 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  37.16 
 
 
275 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  33.63 
 
 
294 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  38.2 
 
 
274 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  38.07 
 
 
265 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  36.93 
 
 
274 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  31.77 
 
 
279 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  31.77 
 
 
284 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  31.77 
 
 
284 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  36.93 
 
 
274 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  36.93 
 
 
274 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  36.93 
 
 
274 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  36.93 
 
 
274 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  36.93 
 
 
274 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  36.93 
 
 
274 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  36.93 
 
 
274 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  37.64 
 
 
274 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  37.99 
 
 
274 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  36.93 
 
 
270 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  36.93 
 
 
270 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  38.33 
 
 
278 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2961  transposase IS4 family protein  37.64 
 
 
250 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  36.87 
 
 
274 aa  99.4  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  36.87 
 
 
274 aa  99.4  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  36.87 
 
 
274 aa  99.4  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>