More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0457 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0457  insertion element transposase  100 
 
 
222 aa  454  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  99.1 
 
 
279 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  98.65 
 
 
284 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  98.65 
 
 
284 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  80.09 
 
 
283 aa  374  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  64.41 
 
 
287 aa  284  8e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  64.41 
 
 
287 aa  284  8e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  64.41 
 
 
287 aa  284  8e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1109  transposase, IS4  50.45 
 
 
278 aa  207  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138434  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2037  transposase, IS4  50.45 
 
 
278 aa  207  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362395  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2080  transposase, IS4  50.45 
 
 
278 aa  207  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.382451  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2540  transposase, IS4  50.45 
 
 
278 aa  207  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2707  transposase, IS4  50.45 
 
 
278 aa  207  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4006  transposase, IS4  50.45 
 
 
278 aa  207  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3998  transposase, IS4  52 
 
 
237 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1950  transposase, IS4 family protein  49.71 
 
 
206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  41.18 
 
 
308 aa  157  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  39.91 
 
 
274 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  37.5 
 
 
280 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  39.63 
 
 
270 aa  141  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  39.63 
 
 
270 aa  141  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  39.63 
 
 
270 aa  141  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  39.63 
 
 
270 aa  141  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  39.63 
 
 
270 aa  141  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  39.63 
 
 
270 aa  141  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  39.63 
 
 
270 aa  141  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  39.63 
 
 
270 aa  141  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  37.79 
 
 
275 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  37.67 
 
 
266 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  39.74 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  37.73 
 
 
274 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  35.32 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  36.24 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  35.59 
 
 
270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  35.02 
 
 
278 aa  131  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  35.02 
 
 
278 aa  131  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  35.02 
 
 
278 aa  131  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  35.02 
 
 
278 aa  131  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  35.02 
 
 
278 aa  131  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  35.02 
 
 
278 aa  131  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  35.02 
 
 
278 aa  131  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  35.02 
 
 
278 aa  131  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  35.02 
 
 
278 aa  131  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  35.02 
 
 
278 aa  131  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  35.02 
 
 
278 aa  131  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  35.02 
 
 
278 aa  131  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1708  transposase IS4 family protein  37.44 
 
 
273 aa  131  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  37.9 
 
 
274 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  36.99 
 
 
274 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  37.9 
 
 
274 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  37.9 
 
 
274 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  37.67 
 
 
280 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  36.07 
 
 
274 aa  129  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  35.4 
 
 
274 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  36.07 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  36.07 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  36.07 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  36.07 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  36.07 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  36.07 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  33.64 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  36.07 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  36.07 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  33.64 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  37.9 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  37.9 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2961  transposase IS4 family protein  38.81 
 
 
250 aa  128  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  39.68 
 
 
271 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  38.99 
 
 
278 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  34.67 
 
 
274 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  34.55 
 
 
274 aa  125  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  34.67 
 
 
274 aa  125  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0091  transposase, IS4 family protein  36.99 
 
 
270 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0399  transposase, IS4 family protein  36.99 
 
 
270 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1399  transposase, IS4 family protein  36.99 
 
 
270 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.878322  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1799  transposase, IS4 family protein  36.99 
 
 
270 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.087482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2423  transposase, IS4 family protein  36.99 
 
 
270 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2530  transposase, IS4 family protein  36.99 
 
 
270 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2707  transposase, IS4 family protein  36.99 
 
 
270 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2939  transposase, IS4 family protein  36.99 
 
 
270 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393582  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3263  transposase, IS4 family protein  36.99 
 
 
270 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3765  transposase, IS4 family protein  36.99 
 
 
270 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4617  transposase, IS4 family protein  36.99 
 
 
270 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  35.16 
 
 
274 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  34.67 
 
 
274 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  34.59 
 
 
276 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2390  transposase IS4 family protein  36.92 
 
 
274 aa  124  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>