More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1950 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1950  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
206 aa  417  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1109  transposase, IS4  58.33 
 
 
278 aa  222  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138434  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2037  transposase, IS4  58.33 
 
 
278 aa  222  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362395  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2540  transposase, IS4  58.33 
 
 
278 aa  222  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2707  transposase, IS4  58.33 
 
 
278 aa  222  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3998  transposase, IS4  58.33 
 
 
237 aa  221  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4006  transposase, IS4  58.33 
 
 
278 aa  222  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2080  transposase, IS4  58.33 
 
 
278 aa  221  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.382451  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  51.02 
 
 
283 aa  195  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  47.55 
 
 
279 aa  190  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  47.55 
 
 
284 aa  190  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  47.55 
 
 
284 aa  190  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  48.76 
 
 
287 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  48.76 
 
 
287 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  48.76 
 
 
287 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0457  insertion element transposase  49.71 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  42.08 
 
 
308 aa  147  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  40.32 
 
 
278 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  38.21 
 
 
275 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  35.12 
 
 
270 aa  119  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  39.57 
 
 
295 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  39.57 
 
 
295 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  39.57 
 
 
295 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  37.43 
 
 
278 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  35.92 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  35.68 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  40.44 
 
 
270 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  40.44 
 
 
270 aa  115  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  36.32 
 
 
294 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  35.68 
 
 
278 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  35.68 
 
 
278 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  35.68 
 
 
278 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  35.68 
 
 
278 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  35.68 
 
 
278 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  35.68 
 
 
278 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  35.68 
 
 
278 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  35.68 
 
 
278 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  35.68 
 
 
278 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  35.68 
 
 
278 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  35.68 
 
 
278 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  35.68 
 
 
278 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2057  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6956  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8548  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.303923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0928  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4866  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  36.07 
 
 
274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2689  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2130  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7344  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0942  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8570  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3172  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2970  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0996557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2551  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0640  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8348  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7484  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3566  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6121  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  36.61 
 
 
274 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  38.25 
 
 
268 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  36.76 
 
 
275 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7626  transposase IS4 family protein  38.59 
 
 
298 aa  111  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  35.52 
 
 
274 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
266 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  37.16 
 
 
268 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  35.52 
 
 
274 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  36.18 
 
 
280 aa  107  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  35.52 
 
 
274 aa  107  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2961  transposase IS4 family protein  38.04 
 
 
250 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  35.52 
 
 
274 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3747  transposase IS4 family protein  34.43 
 
 
253 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  42.57 
 
 
276 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  35.14 
 
 
273 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  35.14 
 
 
273 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  35.52 
 
 
270 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  35.52 
 
 
270 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  35.52 
 
 
270 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  35.71 
 
 
224 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  35.52 
 
 
270 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  35.52 
 
 
270 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  35.52 
 
 
270 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  35.52 
 
 
270 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  35.52 
 
 
270 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  34.83 
 
 
280 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3379  transposase IS4 family protein  37.5 
 
 
285 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>