More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2390 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2390  transposase IS4 family protein  100 
 
 
274 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  36.94 
 
 
278 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  36.94 
 
 
278 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  36.94 
 
 
278 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  36.94 
 
 
278 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  36.94 
 
 
278 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  36.94 
 
 
278 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  36.94 
 
 
278 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  36.94 
 
 
278 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  36.94 
 
 
278 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  36.94 
 
 
278 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  36.94 
 
 
278 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  36.94 
 
 
278 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  33.82 
 
 
274 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  38.17 
 
 
287 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  38.17 
 
 
287 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  38.17 
 
 
287 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  35.07 
 
 
270 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  39.55 
 
 
280 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  36.94 
 
 
278 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  37.12 
 
 
274 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  36.03 
 
 
276 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  35.04 
 
 
275 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  37.23 
 
 
273 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  37.23 
 
 
273 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  37.79 
 
 
275 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  38.61 
 
 
308 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  37.01 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  35.8 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  35.8 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  35.8 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  35.8 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  35.8 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  35.8 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  35.8 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  35.8 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  36.84 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  35.8 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  35.18 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4011  transposase IS4 family protein  35.18 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000062749  hitchhiker  0.0000247291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  35.18 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0651195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4446  transposase IS4 family protein  35.18 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39932  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5329  transposase IS4 family protein  35.18 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0475309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  35.58 
 
 
283 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2080  transposase, IS4  40.16 
 
 
278 aa  145  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.382451  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  38.49 
 
 
295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  38.49 
 
 
295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  38.49 
 
 
295 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  36.61 
 
 
284 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  36.61 
 
 
284 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1109  transposase, IS4  39.76 
 
 
278 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138434  normal  0.273152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2037  transposase, IS4  39.76 
 
 
278 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362395  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2540  transposase, IS4  39.76 
 
 
278 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2707  transposase, IS4  39.76 
 
 
278 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4006  transposase, IS4  39.76 
 
 
278 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  36.73 
 
 
274 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  36.84 
 
 
274 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  36.84 
 
 
274 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  36.4 
 
 
274 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  34.94 
 
 
268 aa  142  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  37.11 
 
 
280 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  35.02 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  34.57 
 
 
268 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  36 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  36 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  36 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  36 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8570  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8548  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.303923  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8348  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12651  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  36 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  36 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0928  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548046  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2130  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2057  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2970  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0996557  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0942  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0640  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2689  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2551  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3172  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.274385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3566  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4866  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6121  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6956  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7344  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.298249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7484  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 
285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  33.82 
 
 
294 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1298  transposase IS4 family protein  37.25 
 
 
269 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  34 
 
 
265 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2925  transposase IS4 family protein  35.74 
 
 
269 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  35.53 
 
 
274 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  34.46 
 
 
271 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7626  transposase IS4 family protein  35.51 
 
 
298 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  35.96 
 
 
274 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2707  transposase, IS4 family protein  36.63 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2939  transposase, IS4 family protein  36.63 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393582  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3263  transposase, IS4 family protein  36.63 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3765  transposase, IS4 family protein  36.63 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4617  transposase, IS4 family protein  36.63 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>