70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3186 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3186  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 245 aa  508  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  54.27 
 
 		 237 aa  278  5e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5034  Methyltransferase type 12  52.56 
 
 		 237 aa  265  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  41.05 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  30.71 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2534  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  29.61 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  29.66 
 
 		 252 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2036  Methyltransferase type 12  30.6 
 
 		 231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3795  SAM-dependent methyltransferase  29.39 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1187  methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.683233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4711  methyltransferase type 12  29.88 
 
 		 217 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  26.89 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  26.78 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  27.23 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  24.78 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2113  Methyltransferase type 12  28.02 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294106  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2808  hypothetical protein  29.67 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.911187 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  27.43 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  23.61 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  26.36 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2197  hypothetical protein  26.85 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1092  methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0252  hypothetical protein  21.59 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1513  hypothetical protein  25.25 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  0.422698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  27.05 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  32.32 
 
 		 259 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  25.31 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  27.45 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  27.45 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  27.45 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  27.45 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  27.45 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  27.45 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  27.38 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  28.81 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.22 
 
 		 240 aa  45.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0772  Methyltransferase type 12  24.04 
 
 		 310 aa  45.4  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  23.33 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0917  MCP methyltransferase CheR-type  23.77 
 
 		 384 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 246 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  27.38 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  27.59 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  26.51 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  26.51 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  27.08 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  28.71 
 
 		 203 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2003  methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  22.64 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  25.78 
 
 		 267 aa  42.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  21 
 
 		 317 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.4 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1254  methyltransferase type 12  27.68 
 
 		 226 aa  42.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.452774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.7 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  24 
 
 		 365 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 242 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  30.93 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 251 aa  42  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0934  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  27.16 
 
 		 402 aa  42  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1203  hypothetical protein  22.66 
 
 		 239 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.322275  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  36.49 
 
 		 242 aa  42  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>