More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35010 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35010  selenocysteine lyase  100 
 
 		 482 aa  942    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2942  Cysteine desulfurase  72.71 
 
 		 480 aa  615  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2391  Cysteine desulfurase  69.98 
 
 		 478 aa  613  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.855835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3118  Cysteine desulfurase  72.28 
 
 		 476 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0508  Cysteine desulfurase  60.91 
 
 		 487 aa  511  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0935  aminotransferase class V  63.29 
 
 		 448 aa  471  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239367  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2656  cysteine desulfurase  56.37 
 
 		 470 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  54.93 
 
 		 472 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3438  cysteine desulfurase  63.05 
 
 		 445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4922  cysteine desulfurase  54.7 
 
 		 518 aa  448  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0546  Cysteine desulfurase  57.75 
 
 		 429 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0273  aminotransferase class V  59.77 
 
 		 439 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.593145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0783  Cysteine desulfurase  52.04 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5748  aminotransferase class V  52.97 
 
 		 452 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380552  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5990  Cysteine desulfurase  50.35 
 
 		 467 aa  352  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.122747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0847  aminotransferase class V  51.71 
 
 		 449 aa  342  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.178822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9167  Cysteine desulfurase  53.41 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3439  cysteine desulfurase  51.57 
 
 		 457 aa  331  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0318  cysteine desulfurase  50.64 
 
 		 414 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159519  hitchhiker  0.000213792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0275  aminotransferase, class V  50.39 
 
 		 414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0252691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  37.26 
 
 		 452 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  34.75 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  32.62 
 
 		 428 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  32.23 
 
 		 428 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  34.92 
 
 		 470 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.2 
 
 		 414 aa  231  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.43 
 
 		 415 aa  223  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  31.84 
 
 		 485 aa  221  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.71 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  36.61 
 
 		 413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.2 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.42 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  34.05 
 
 		 460 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.24 
 
 		 414 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  34.86 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.62 
 
 		 418 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.37 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.82 
 
 		 644 aa  213  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  36.5 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  35.2 
 
 		 604 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  35.2 
 
 		 604 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.25 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.8 
 
 		 407 aa  210  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.08 
 
 		 415 aa  210  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.57 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.76 
 
 		 429 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  35.16 
 
 		 422 aa  209  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  32.16 
 
 		 414 aa  209  7e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.02 
 
 		 610 aa  209  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.19 
 
 		 414 aa  209  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  35.56 
 
 		 407 aa  209  9e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  37.5 
 
 		 429 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  36.76 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  35.19 
 
 		 404 aa  208  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.3 
 
 		 425 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.13 
 
 		 409 aa  206  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.1 
 
 		 418 aa  206  9e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  34.46 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.2 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  32.07 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.65 
 
 		 605 aa  205  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.44 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.86 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  32.99 
 
 		 420 aa  204  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  35.1 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.92 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.25 
 
 		 406 aa  204  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.31 
 
 		 408 aa  203  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.59 
 
 		 417 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.54 
 
 		 417 aa  203  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.59 
 
 		 417 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  32.55 
 
 		 420 aa  203  6e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.01 
 
 		 414 aa  203  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.14 
 
 		 403 aa  203  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.36 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  33.74 
 
 		 414 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  34.02 
 
 		 688 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.99 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.53 
 
 		 650 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.44 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  36.9 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.88 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.33 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.31 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  34.91 
 
 		 410 aa  201  3e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.3 
 
 		 415 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.01 
 
 		 417 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.82 
 
 		 560 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  34.46 
 
 		 395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.02 
 
 		 621 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.28 
 
 		 412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.33 
 
 		 414 aa  201  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  34.18 
 
 		 666 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  34.29 
 
 		 885 aa  200  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  36.55 
 
 		 417 aa  200  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.73 
 
 		 451 aa  200  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.02 
 
 		 666 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  35.03 
 
 		 413 aa  199  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  34.01 
 
 		 414 aa  199  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.3 
 
 		 407 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>