More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27750 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2505  DEAD/DEAH box helicase domain protein  73.98 
 
 
561 aa  690    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000169181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1166  DEAD/DEAH box helicase domain protein  72.07 
 
 
565 aa  651    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0774  DEAD/DEAH box helicase domain protein  78.46 
 
 
605 aa  727    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2906  DEAD/DEAH box helicase domain protein  77.65 
 
 
580 aa  682    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.109647  normal  0.0319013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27750  DNA/RNA helicase, superfamily II  100 
 
 
593 aa  1179    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.417961  normal  0.390673 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  82.96 
 
 
598 aa  747    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0648201  hitchhiker  0.00334068 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0707  DEAD/DEAH box helicase domain protein  79.54 
 
 
544 aa  723    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2785  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  74.6 
 
 
585 aa  694    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123972  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15280  DNA/RNA helicase, superfamily II  71.9 
 
 
611 aa  634  1e-180  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19230  DNA/RNA helicase, superfamily II  70.87 
 
 
499 aa  625  1e-178  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0355772 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11320  DNA/RNA helicase, superfamily II  69.48 
 
 
582 aa  619  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.381496  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.71 
 
 
611 aa  593  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214353  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2167  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.75 
 
 
586 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230616  decreased coverage  0.0000613257 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3809  DEAD/DEAH box helicase-like  66.27 
 
 
649 aa  571  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.130283  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0916  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.19 
 
 
671 aa  567  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0853384  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0824  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.62 
 
 
609 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8393  hypothetical protein  62 
 
 
697 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.671179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06650  DNA/RNA helicase, superfamily II  63.25 
 
 
559 aa  544  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0514  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  61.28 
 
 
503 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.76 
 
 
618 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.21 
 
 
548 aa  528  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000480349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.53 
 
 
621 aa  525  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4603  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.78 
 
 
557 aa  521  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884442  normal  0.136344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.67 
 
 
565 aa  510  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1393  DEAD/DEAH box helicase-like protein  60.29 
 
 
507 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1411  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.29 
 
 
507 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1791  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.39 
 
 
494 aa  511  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274461  normal  0.240884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1447  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.85 
 
 
507 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7820  DEAD/DEAH box helicase domain protein  69.36 
 
 
795 aa  508  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3515  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.17 
 
 
543 aa  505  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.394207  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4676  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.63 
 
 
505 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278319  normal  0.217284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3832  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.86 
 
 
516 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.11 
 
 
536 aa  501  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13237  ATP-dependent RNA helicase rhlE  59.8 
 
 
527 aa  498  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.462148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1469  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.07 
 
 
479 aa  488  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45325  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.7 
 
 
533 aa  346  7e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.56 
 
 
541 aa  345  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  44.1 
 
 
530 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  39.72 
 
 
664 aa  325  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  45.12 
 
 
655 aa  325  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  39.72 
 
 
664 aa  324  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  39.72 
 
 
664 aa  324  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  44.57 
 
 
589 aa  323  7e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.47 
 
 
530 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4470  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.99 
 
 
564 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.230893 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.07 
 
 
467 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.72 
 
 
559 aa  319  9e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.92 
 
 
550 aa  318  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.59 
 
 
629 aa  318  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.59 
 
 
629 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.59 
 
 
629 aa  318  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3573  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.59 
 
 
629 aa  318  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.58 
 
 
571 aa  317  4e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.59 
 
 
629 aa  317  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.54 
 
 
653 aa  317  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03029  ATP-dependent RNA helicase  44.59 
 
 
629 aa  317  5e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.59 
 
 
629 aa  317  5e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  44.59 
 
 
629 aa  317  5e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.05 
 
 
528 aa  317  5e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3458  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.59 
 
 
629 aa  317  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.438364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.59 
 
 
629 aa  317  5e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419869 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3635  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.59 
 
 
629 aa  316  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.93 
 
 
539 aa  316  8e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3354  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.59 
 
 
651 aa  316  9e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.59 
 
 
651 aa  316  9e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3609  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.59 
 
 
651 aa  316  9e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0626  inducible ATP-independent RNA helicase  43.3 
 
 
591 aa  316  9.999999999999999e-85  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.22 
 
 
597 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.5 
 
 
632 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.77 
 
 
625 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.8 
 
 
621 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.5 
 
 
532 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.06 
 
 
624 aa  313  5.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.2 
 
 
415 aa  312  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.27 
 
 
546 aa  311  2e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  43.05 
 
 
527 aa  311  2e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  42.7 
 
 
579 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.84 
 
 
694 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0117058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.75 
 
 
747 aa  311  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.05 
 
 
546 aa  310  4e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.94 
 
 
466 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  41.41 
 
 
551 aa  310  5.9999999999999995e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.54 
 
 
606 aa  309  6.999999999999999e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.69 
 
 
557 aa  310  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.69 
 
 
557 aa  310  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.69 
 
 
557 aa  310  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0037  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.88 
 
 
460 aa  309  8e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.25 
 
 
640 aa  309  8e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.25 
 
 
640 aa  309  8e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.25 
 
 
640 aa  309  8e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.25 
 
 
640 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.51 
 
 
538 aa  309  9e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.79 
 
 
525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.79 
 
 
528 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0191  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.82 
 
 
609 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  44.79 
 
 
528 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  44.79 
 
 
528 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.79 
 
 
528 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.82 
 
 
595 aa  309  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.59 
 
 
589 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>