More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19720 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_19720  short-chain alcohol dehydrogenase  100 
 
 
312 aa  609  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608128  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.52 
 
 
309 aa  337  9.999999999999999e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17893  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  41.07 
 
 
306 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  41.07 
 
 
306 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  40.75 
 
 
306 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  39.55 
 
 
300 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  38.56 
 
 
300 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  38.56 
 
 
300 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
312 aa  143  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  40.81 
 
 
303 aa  142  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.66 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  37.58 
 
 
305 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
298 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  39.18 
 
 
305 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  36.16 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.41 
 
 
329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
301 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  34.08 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  34.41 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  34.41 
 
 
329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  36.81 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  37.58 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.55 
 
 
327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
317 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.44 
 
 
328 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
309 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
324 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  37.5 
 
 
306 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.1 
 
 
298 aa  123  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 
314 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  34.19 
 
 
308 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
307 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 
304 aa  122  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
315 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 
320 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.42 
 
 
314 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.33 
 
 
328 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 
305 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  33.23 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  35.67 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
308 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.12 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2577  short chain dehydrogenase  34.49 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  29.61 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.81 
 
 
307 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
319 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.44 
 
 
305 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  25.41 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  25.41 
 
 
309 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  25.9 
 
 
309 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0618  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 
328 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
316 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
320 aa  106  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3626  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.67 
 
 
306 aa  105  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.55 
 
 
304 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  37.58 
 
 
299 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  24.75 
 
 
309 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 
303 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
297 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  33.44 
 
 
312 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
309 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  32.36 
 
 
301 aa  103  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  32.8 
 
 
302 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  30.32 
 
 
300 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.72 
 
 
305 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
306 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5768  putative short chain dehydrogenase  33.76 
 
 
309 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
303 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
298 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66520  putative short chain dehydrogenase  33.44 
 
 
309 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.973643  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  33.02 
 
 
318 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  25.94 
 
 
318 aa  99.8  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
328 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.55 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.55 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.55 
 
 
289 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
320 aa  97.1  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  36.5 
 
 
324 aa  96.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
306 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.54 
 
 
288 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.53 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 
288 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
298 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 
290 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
312 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5172  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
278 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
278 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>