More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11590 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  100 
 
 		 362 aa  713    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  46.87 
 
 		 336 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  46.5 
 
 		 340 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  47.49 
 
 		 348 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  47.16 
 
 		 348 aa  265  8.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  45.45 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  46.71 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  47.33 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  43.54 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  45.4 
 
 		 339 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  44.11 
 
 		 328 aa  249  6e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  44.81 
 
 		 339 aa  249  6e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0748  transcriptional regulator, LacI family  45.03 
 
 		 346 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0494571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  43.54 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  44.82 
 
 		 333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  41.24 
 
 		 359 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  41.37 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  43.98 
 
 		 358 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  43.73 
 
 		 352 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  43.31 
 
 		 342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  43.02 
 
 		 351 aa  232  9e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  43.47 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  42.66 
 
 		 359 aa  226  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0400  transcriptional regulator, LacI family  46.18 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  39.66 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0276  transcriptional regulator, LacI family  41.16 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  40.24 
 
 		 368 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 340 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  41.5 
 
 		 359 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 343 aa  194  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  38.02 
 
 		 353 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  34.04 
 
 		 358 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0916  transcriptional regulator, LacI family  41.37 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684035  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0930  LacI family response repressor  36.92 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.562853  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01060  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0887305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  33.33 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.13 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0927  lac repressor  35.4 
 
 		 355 aa  186  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0196781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  34.3 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  32.53 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 		 337 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  35.63 
 
 		 338 aa  180  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 332 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.04 
 
 		 331 aa  179  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  33.43 
 
 		 328 aa  179  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  38.04 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2911  transcriptional regulator, LacI family  39.17 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2013  lac repressor  34.44 
 
 		 356 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  38.44 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.78 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.03 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  31.33 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0817  transcriptional regulator, LacI family  39.27 
 
 		 342 aa  169  7e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.533751  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  36.8 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.67 
 
 		 342 aa  165  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  32.34 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000396722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  33.72 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2606  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  34.13 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  31.78 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0881  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.03 
 
 		 325 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188257  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  32.85 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.93 
 
 		 368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  36.34 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1021  LacI family response repressor  35.44 
 
 		 371 aa  162  8.000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  31.56 
 
 		 363 aa  162  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000862656  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  31.56 
 
 		 363 aa  162  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  37.95 
 
 		 353 aa  162  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00299  lac repressor  31.75 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  31.75 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  31.75 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000170376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  33.92 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  31.75 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  33.92 
 
 		 332 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  31.27 
 
 		 363 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  31.56 
 
 		 363 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000375664  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  32.02 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000822114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.31 
 
 		 333 aa  161  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  31.23 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  35.12 
 
 		 330 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  33.92 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  35.8 
 
 		 344 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  33.92 
 
 		 332 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.51 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  33.43 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  33.63 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  33.63 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0922  lac repressor  28.81 
 
 		 357 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.43 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  33.63 
 
 		 332 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  33.63 
 
 		 332 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  34.41 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3358  lac repressor  28.21 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0976  lac repressor  28.21 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.63 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1486  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 		 334 aa  156  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.479144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>