49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01660 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  578  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  64.78 
 
 		 293 aa  282  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  46.83 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  50.94 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  45.32 
 
 		 294 aa  211  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  43.12 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  45.15 
 
 		 300 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  35.38 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  38.52 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  42.48 
 
 		 270 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  31.46 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  28.86 
 
 		 327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  32.27 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  31.6 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  31.25 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1205  ABC transporter integral membrane protein  41.06 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  29.35 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  28.86 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  28.63 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  27.24 
 
 		 303 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0749  hypothetical protein  38.66 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  30.09 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  28.2 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  26.84 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  25.86 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2486  hypothetical protein  36 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3920  bacitracin transport permease protein BCRB  35.21 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  24.63 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  32.39 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1810  bacitracin transport permease protein BcrB  31.58 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367153  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2347  hypothetical protein  30.43 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5578  ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5080  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  35.21 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0496537  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  30.58 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2337  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5649  ABC transporter permease  35.21 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  30.58 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5251  ABC transporter permease  35.21 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6156  hypothetical protein  28.04 
 
 		 457 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.416994  normal  0.477374 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5494  ABC transporter, permease protein  35.21 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  30.58 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  30.58 
 
 		 278 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  37.18 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5429  ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5097  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  35.21 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0254  nitrous-oxide reductase, nosY component  36.36 
 
 		 276 aa  42.4  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  35.14 
 
 		 276 aa  42.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0278  nitrous-oxide reductase, nosY component  36.36 
 
 		 276 aa  42.4  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>