More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01540 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_01540  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  100 
 
 
587 aa  1098    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2661  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.41 
 
 
556 aa  227  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1279  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  36.36 
 
 
565 aa  226  7e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0999  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.02 
 
 
574 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1581  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  43.56 
 
 
563 aa  199  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1023  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  40.66 
 
 
555 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.057602  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0811  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  49.06 
 
 
558 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.65371  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1038  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  41.32 
 
 
544 aa  151  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0466413 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  27.81 
 
 
500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0918  NADH dehydrogenase (quinone)  29.58 
 
 
559 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0509  NADH dehydrogenase (quinone)  28.37 
 
 
748 aa  127  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000352419  hitchhiker  0.0000000405513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1702  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.33 
 
 
544 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0585222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  33.05 
 
 
637 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  32.68 
 
 
649 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  34.91 
 
 
683 aa  110  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0184  NADH dehydrogenase (quinone)  30.84 
 
 
487 aa  109  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  37.02 
 
 
669 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  32.36 
 
 
671 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  30.43 
 
 
669 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  33.88 
 
 
672 aa  107  6e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  36.6 
 
 
748 aa  106  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1252  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  33.09 
 
 
485 aa  106  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.6 
 
 
513 aa  106  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  30.23 
 
 
672 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  30.23 
 
 
672 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  32.92 
 
 
672 aa  105  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  32.92 
 
 
672 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  32.92 
 
 
672 aa  105  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  32.92 
 
 
672 aa  104  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  32.74 
 
 
669 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  36.26 
 
 
669 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  36.74 
 
 
669 aa  103  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  38.08 
 
 
687 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.59 
 
 
492 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  28.34 
 
 
643 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  36.55 
 
 
674 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2796  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  32.41 
 
 
537 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  34.93 
 
 
674 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  27.94 
 
 
492 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  33.45 
 
 
672 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  29.64 
 
 
644 aa  100  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  31.1 
 
 
674 aa  99.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  34.63 
 
 
667 aa  99.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2601  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.99 
 
 
660 aa  99  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  28.7 
 
 
504 aa  99  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0720  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.43 
 
 
504 aa  99.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.362005  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2882  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  29.53 
 
 
534 aa  99  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.139376  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2742  NADH dehydrogenase (quinone)  28.84 
 
 
497 aa  99  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0379  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.82 
 
 
605 aa  98.2  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000619684  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.15 
 
 
545 aa  98.6  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0511  NADH ubiquinone/plastoquinone complex subunit, putative  35.23 
 
 
488 aa  98.2  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  29.75 
 
 
673 aa  98.2  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30370  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit 4 (chain M)  30.84 
 
 
470 aa  98.2  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  35.04 
 
 
668 aa  97.4  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3145  NADH dehydrogenase (quinone)  32.36 
 
 
462 aa  97.4  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0694322  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0778  NADH dehydrogenase (quinone)  32.73 
 
 
682 aa  97.1  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  33.45 
 
 
661 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2712  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.73 
 
 
574 aa  96.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  28.36 
 
 
662 aa  96.7  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  30.2 
 
 
617 aa  96.3  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0772  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.85 
 
 
496 aa  95.9  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.256181  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1399  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter MnhD subunit-like protein  27.27 
 
 
437 aa  95.9  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2819  NADH dehydrogenase subunit M  27.61 
 
 
502 aa  95.9  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1205  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.02 
 
 
471 aa  96.3  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425489  normal  0.0100074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  36.11 
 
 
668 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  31.65 
 
 
542 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  35.71 
 
 
654 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  28.83 
 
 
525 aa  95.5  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  29.13 
 
 
644 aa  95.1  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  31.65 
 
 
542 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  31.65 
 
 
542 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18950  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.04 
 
 
543 aa  94.7  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0917  NADH dehydrogenase (quinone)  32.16 
 
 
486 aa  94.7  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.958268  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  29.35 
 
 
679 aa  94.7  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2787  NADH dehydrogenase (quinone)  33.48 
 
 
633 aa  94.7  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2795  NADH dehydrogenase (quinone)  33.48 
 
 
633 aa  94.7  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1398  NADH dehydrogenase (quinone)  30.03 
 
 
498 aa  94.4  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1000  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.28 
 
 
507 aa  94  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.827251 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  28.32 
 
 
519 aa  94.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1420  NADH dehydrogenase (quinone)  29.09 
 
 
1265 aa  94  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  30.96 
 
 
673 aa  94.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3185  NADH dehydrogenase (quinone)  31.4 
 
 
552 aa  94  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3886  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  32.18 
 
 
560 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0496  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.42 
 
 
565 aa  94  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  34.84 
 
 
666 aa  94  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.95 
 
 
688 aa  94  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  37.14 
 
 
666 aa  94  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.33 
 
 
659 aa  93.6  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4494  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  30.82 
 
 
496 aa  94  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704587  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3241  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  28.71 
 
 
561 aa  94  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3836  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4  32.18 
 
 
560 aa  93.6  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  28.83 
 
 
535 aa  93.6  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2743  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter MnhD subunit-like protein  29.07 
 
 
433 aa  93.6  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  30.55 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3430  NADH dehydrogenase I, M subunit  31.47 
 
 
496 aa  93.2  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05170  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  31.43 
 
 
521 aa  92.8  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  32.33 
 
 
737 aa  92.8  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.89 
 
 
492 aa  92  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  28.47 
 
 
535 aa  92.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4469  NADH dehydrogenase (quinone)  38.07 
 
 
664 aa  92.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>