More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3558 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3558  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  314  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3924  AsnC family transcriptional regulator  67.33 
 
 		 150 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  58 
 
 		 156 aa  189  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 154 aa  186  9e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 174 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  40.79 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0211  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.58193 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  37.91 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2907  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3153  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3906  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3824  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 154 aa  120  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2823  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.666303  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  38.69 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  41.33 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3973  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.918788  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  37.75 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  38.16 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 181 aa  114  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2253  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 150 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41621 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 196 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 157 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 161 aa  113  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4335  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.22 
 
 		 163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  38.41 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4793  transcriptional regulator, AsnC family  39.22 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3253  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.723114  normal  0.861381 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  35.93 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2249  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.17304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0019  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  35.93 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  36.02 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 		 166 aa  111  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  40.13 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5103  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 162 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651291 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  37.09 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>