48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0332 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0332  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0339  hypothetical protein  89.34 
 
 		 271 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0342  hypothetical protein  89.34 
 
 		 271 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0334  hypothetical protein  89.58 
 
 		 256 aa  430  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0438  hypothetical protein  82.03 
 
 		 255 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4376  hypothetical protein  69.03 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0342  hypothetical protein  68.28 
 
 		 272 aa  315  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3684  hypothetical protein  74.68 
 
 		 272 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0333  hypothetical protein  71.85 
 
 		 280 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0317  hypothetical protein  48.78 
 
 		 267 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282593 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0344  hypothetical protein  44.06 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4604  hypothetical protein  48.53 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0889286 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3896  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.24 
 
 		 248 aa  175  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3519  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.71 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3387  hypothetical protein  36.68 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0935  hypothetical protein  32.41 
 
 		 232 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3056  conserved hypothetical signal peptide protein  29.09 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00817533  normal  0.285808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3915  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.27 
 
 		 209 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0708883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0698  putative signal peptide protein  28.74 
 
 		 222 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.694204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004072  putative transmembrane protein  32.37 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00776  putative signal peptide protein  26.7 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4576  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.67 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0431  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.32 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11559  normal  0.169365 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4385  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.7 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729066  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3692  putative signal peptide protein  27.54 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.378144 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4769  conserved hypothetical signal peptide protein  27.54 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4081  putative signal peptide protein  26.38 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.09 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0430  hypothetical protein  30.06 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2095  putative outer membrane protein  29.19 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0897  putative outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.24 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5101  hypothetical protein  27.84 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3606  putative signal peptide protein  24.54 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4808  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0120  hypothetical protein  31.29 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000151321  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2754  hypothetical protein  27.54 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.217605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3881  hypothetical protein  26.14 
 
 		 187 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03850  hypothetical protein  23.84 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.267163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1085  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.95 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3982  putative transmembrane protein  24.39 
 
 		 197 aa  45.4  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2815  hypothetical protein  25.7 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.038116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2682  hypothetical protein  26.62 
 
 		 214 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.791709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2149  hypothetical protein  27.92 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0527214  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0318  hypothetical protein  25.57 
 
 		 198 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2763  hypothetical protein  27.92 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000234999  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0430  putative transmembrane protein  25.69 
 
 		 211 aa  42.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619167  normal  0.969079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6093  hypothetical protein  25.32 
 
 		 220 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal  0.339502 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1375  putative transmembrane protein  27.81 
 
 		 216 aa  42.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  hitchhiker  0.00143441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>