48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23150 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23150  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  100 
 
 		 240 aa  475  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2623  hypothetical protein  44.05 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2319  cobalt transport protein  37.93 
 
 		 245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.945459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4773  cobalt transport protein  40 
 
 		 239 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25720  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  36.77 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2306  cobalt transport protein  37 
 
 		 257 aa  120  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1768  cobalt transport protein  30.66 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0330  cobalt transport protein  35.62 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0283  transporter, putative  31.02 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0323  cobalt transport protein  35.86 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0420  cobalt ABC transporter permease  33.84 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0190437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2654  cobalt transport protein  30.7 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4597  cobalt transport protein  28.77 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  28.77 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0678  cobalt transport protein  32.52 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0905  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.313677  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1433  cobalt transport protein  31.22 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.43153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2157  ABC transporter, permease protein, putative  30.56 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000133808  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1597  transporter, putative  29.19 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0242  hypothetical protein  30.88 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3088  cobalt transport protein  30.66 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0314  cobalt transport protein  31.01 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.892766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1483  cobalt transport protein  29.51 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0335  cobalt transport protein  30.83 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0256  hypothetical protein  28.57 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0899  ABC transporter, permease protein, putative  28.46 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00730  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  35.71 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.648464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05107  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ  27.69 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  26.56 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  26.98 
 
 		 279 aa  53.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1990  putative cobalt transport protein  26.92 
 
 		 279 aa  52.4  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.024453  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  27.13 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0310  hypothetical protein  29.37 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0573771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  22.45 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  22.45 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  25.66 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  25.66 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1493  cobalt transport protein  25.71 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.192292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  30.39 
 
 		 270 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  21.93 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  25.45 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  23.23 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  26.67 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1604  ABC transporter, permease protein, putative  22.97 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.72 
 
 		 293 aa  42.4  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  26.09 
 
 		 276 aa  42.4  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  23.08 
 
 		 268 aa  42  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  26.24 
 
 		 262 aa  42  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>