More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21550 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21550  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 418 aa  858    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.968894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1035  Glycine hydroxymethyltransferase  74.4 
 
 		 418 aa  639    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314303 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12140  serine hydroxymethyltransferase  74.28 
 
 		 417 aa  623  1e-177  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  61.34 
 
 		 422 aa  522  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 		 413 aa  521  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 		 414 aa  518  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 		 413 aa  519  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  62.29 
 
 		 411 aa  518  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 		 413 aa  518  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 		 410 aa  519  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 414 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 413 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 413 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  61.5 
 
 		 412 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 		 410 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  61.74 
 
 		 413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 414 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  61.61 
 
 		 415 aa  512  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 413 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 412 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 414 aa  511  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 418 aa  507  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0790  serine hydroxymethyltransferase  61.18 
 
 		 415 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 415 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  60.58 
 
 		 414 aa  506  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3100  serine hydroxymethyltransferase  60.69 
 
 		 414 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.208714  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  61.29 
 
 		 421 aa  502  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 412 aa  502  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  60.1 
 
 		 415 aa  502  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 415 aa  502  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  60.83 
 
 		 417 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  62.01 
 
 		 413 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 427 aa  501  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 416 aa  500  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  58.71 
 
 		 422 aa  500  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2680  serine hydroxymethyltransferase  60.44 
 
 		 508 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  60.15 
 
 		 417 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  59.61 
 
 		 413 aa  501  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 417 aa  500  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  58.41 
 
 		 424 aa  497  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  60.63 
 
 		 432 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  59.37 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  59.8 
 
 		 431 aa  495  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  57.69 
 
 		 425 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  495  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2874  serine hydroxymethyltransferase  59.71 
 
 		 414 aa  495  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 417 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  60.87 
 
 		 433 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  57.69 
 
 		 425 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  58.91 
 
 		 416 aa  496  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  59.02 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  59.42 
 
 		 435 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  59.56 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  59.9 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  58.39 
 
 		 412 aa  493  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  60.53 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  58.47 
 
 		 439 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2907  serine hydroxymethyltransferase  58.92 
 
 		 414 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291862  normal  0.0486853 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  59.09 
 
 		 432 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  58.97 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  59.17 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4276  glycine hydroxymethyltransferase  61.93 
 
 		 451 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.514948  normal  0.0110039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 		 437 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  60.29 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  59.75 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  58.23 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  59.31 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  59.04 
 
 		 432 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  58.15 
 
 		 413 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  58.47 
 
 		 438 aa  491  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  57.38 
 
 		 427 aa  490  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  58.17 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  60.05 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2658  serine hydroxymethyltransferase  58.97 
 
 		 414 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0261213  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0678  serine hydroxymethyltransferase  59.21 
 
 		 415 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0765  serine hydroxymethyltransferase  58.97 
 
 		 415 aa  487  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186767  normal  0.156833 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  59.41 
 
 		 412 aa  488  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  58.25 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 411 aa  487  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  58.92 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0683  serine hydroxymethyltransferase  58.97 
 
 		 431 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  59.07 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  57.57 
 
 		 411 aa  486  1e-136  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>