78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20750 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_20750  conserved protein of DIM6/NTAB family  100 
 
 
186 aa  386  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1404  putative flavoredoxin  53.63 
 
 
178 aa  215  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00640  conserved protein of DIM6/NTAB family  46.37 
 
 
171 aa  162  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.75 
 
 
168 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11280  putative flavoredoxin  35.96 
 
 
168 aa  134  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00035262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  35 
 
 
169 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2772  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  31.29 
 
 
160 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0311  hypothetical protein  30.57 
 
 
160 aa  86.3  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0535887  decreased coverage  0.000000645484 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2093  hypothetical protein  35.19 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.16533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2073  hypothetical protein  30.98 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00879028  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0354  hypothetical protein  32.45 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000126383  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0372  hypothetical protein  32.87 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0202858  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1565  hypothetical protein  30.26 
 
 
170 aa  67  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.66 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1037  hypothetical protein  25.88 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0149874  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
160 aa  62.8  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  27.95 
 
 
208 aa  61.6  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.52 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0597  hypothetical protein  25.79 
 
 
168 aa  58.5  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  33.03 
 
 
176 aa  58.2  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2545  hypothetical protein  28.57 
 
 
170 aa  58.2  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.65 
 
 
195 aa  58.2  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  27.56 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  27.56 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.38 
 
 
194 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  33.64 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  31.25 
 
 
177 aa  54.7  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  34.26 
 
 
200 aa  54.3  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  34.78 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  26.05 
 
 
209 aa  53.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.61 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  30.97 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  31.07 
 
 
190 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.19 
 
 
176 aa  51.2  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.69 
 
 
186 aa  51.2  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.79 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  29.36 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  27.18 
 
 
200 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  23.85 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.78 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  28.44 
 
 
178 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  30.28 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  34.52 
 
 
194 aa  48.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1379  hypothetical protein  26.56 
 
 
189 aa  48.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.203696 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.07 
 
 
190 aa  47.8  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  32.14 
 
 
191 aa  47.8  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0039  hypothetical protein  25 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.1 
 
 
190 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.62 
 
 
192 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3412  hypothetical protein  29.13 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000162179  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.31 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  25.93 
 
 
186 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.41 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.85 
 
 
189 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  30.39 
 
 
189 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  29.7 
 
 
189 aa  45.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  27.18 
 
 
188 aa  45.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  25.77 
 
 
202 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.83 
 
 
197 aa  44.7  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.17 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  30.91 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  25.2 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  28.57 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.83 
 
 
180 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  26.09 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.44 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  20.18 
 
 
192 aa  42.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  29.36 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  29.9 
 
 
189 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.85 
 
 
185 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  27.97 
 
 
183 aa  41.6  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.85 
 
 
193 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.64 
 
 
215 aa  41.6  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  25.23 
 
 
189 aa  41.2  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.85 
 
 
225 aa  41.2  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>