More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3356 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1967  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  66.85 
 
 
549 aa  744    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220593 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3356  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 
565 aa  1161    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1051  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  68.32 
 
 
560 aa  755    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0020  hypothetical protein  67.53 
 
 
395 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0791294  normal  0.122064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1139  NDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid dehydrogenase  28.76 
 
 
475 aa  176  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0049  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.17 
 
 
476 aa  174  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1832  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.88 
 
 
476 aa  171  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213554  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1606  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.08 
 
 
477 aa  165  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2029  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.34 
 
 
472 aa  162  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0823  nucleotide sugar dehydrogenase  31.49 
 
 
493 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.473043  normal  0.732846 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2140  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.76 
 
 
476 aa  158  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.493986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.36 
 
 
418 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0961  nucleotide sugar dehydrogenase  27.69 
 
 
435 aa  144  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  28.33 
 
 
453 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0162  nucleotide sugar dehydrogenase  28.13 
 
 
420 aa  139  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454835  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.12 
 
 
434 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.89 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.32 
 
 
439 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6488  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.95 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1952  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase dimerisation  31.58 
 
 
460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.868357 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05630  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  29.06 
 
 
417 aa  130  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  26.84 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  29.53 
 
 
451 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1309  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.31 
 
 
450 aa  127  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0281238  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1063  nucleotide sugar dehydrogenase  30.7 
 
 
433 aa  127  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  27.75 
 
 
439 aa  126  9e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  27.81 
 
 
416 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0353  nucleotide sugar dehydrogenase  27.17 
 
 
434 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  26.62 
 
 
437 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0335  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.17 
 
 
434 aa  125  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2164  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.37 
 
 
471 aa  125  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4292  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.79 
 
 
440 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  28.13 
 
 
453 aa  123  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.8 
 
 
435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2807  nucleotide sugar dehydrogenase  25.06 
 
 
428 aa  122  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.98 
 
 
435 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  25.39 
 
 
448 aa  120  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  24.87 
 
 
438 aa  120  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4103  nucleotide sugar dehydrogenase  27.93 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2131  nucleotide sugar dehydrogenase  29.04 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.75 
 
 
432 aa  118  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7640  nucleotide sugar dehydrogenase  28.93 
 
 
418 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  26.54 
 
 
440 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  29.69 
 
 
437 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1766  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.58 
 
 
445 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000194311 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4429  nucleotide sugar dehydrogenase  26.75 
 
 
440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4451  nucleotide sugar dehydrogenase  27.07 
 
 
441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6571  nucleotide sugar dehydrogenase  31.91 
 
 
443 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430897  normal  0.0960197 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1675  nucleotide sugar dehydrogenase  28.57 
 
 
440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2529  nucleotide sugar dehydrogenase  26.91 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000174279 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1530  nucleotide sugar dehydrogenase  28.37 
 
 
449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6764  nucleotide sugar dehydrogenase  28.23 
 
 
456 aa  114  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0817646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2863  nucleotide sugar dehydrogenase  26.26 
 
 
447 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3939  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  26.07 
 
 
505 aa  113  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2214  nucleotide sugar dehydrogenase  25.38 
 
 
439 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0680742  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3187  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  27.33 
 
 
437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.878007  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20900  nucleotide sugar dehydrogenase  30.43 
 
 
441 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0359  nucleotide sugar dehydrogenase  25.41 
 
 
439 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2117  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.45 
 
 
444 aa  109  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.95445  decreased coverage  0.00397041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3843  nucleotide sugar dehydrogenase  28.11 
 
 
415 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0234219  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2167  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.14 
 
 
442 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.959713  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1709  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.85 
 
 
449 aa  108  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.676622  normal  0.0907516 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27920  nucleotide sugar dehydrogenase  26.86 
 
 
417 aa  107  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.694602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3827  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  24.03 
 
 
438 aa  107  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.10325  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1733  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  25 
 
 
427 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.720088 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1584  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  23.53 
 
 
427 aa  106  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260621  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4278  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27 
 
 
441 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0210  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  25.91 
 
 
440 aa  104  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125805  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1229  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.34 
 
 
442 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.425997  normal  0.200381 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08960  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  28.72 
 
 
418 aa  103  8e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2174  UDP-glucose 6-dehydrogenase  24.48 
 
 
439 aa  103  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0720947  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5249  nucleotide sugar dehydrogenase  24.84 
 
 
446 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0699  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.11 
 
 
419 aa  103  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136765  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0085  nucleotide sugar dehydrogenase  28.04 
 
 
431 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896059 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2494  nucleotide sugar dehydrogenase  27.63 
 
 
438 aa  102  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3008  nucleotide sugar dehydrogenase  25.48 
 
 
436 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  27.7 
 
 
461 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  26.04 
 
 
438 aa  102  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08980  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  27.15 
 
 
436 aa  101  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.35 
 
 
441 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2378  nucleotide sugar dehydrogenase  28.43 
 
 
460 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000447679  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0203  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  26.63 
 
 
447 aa  101  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.211855  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0509  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 
413 aa  101  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0429  UDP-glucose 6-dehydrogenase  24.2 
 
 
423 aa  101  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0178  nucleotide sugar dehydrogenase  24.94 
 
 
427 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  27.37 
 
 
448 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08740  nucleotide sugar dehydrogenase  25.48 
 
 
433 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.160472  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.39 
 
 
449 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4212  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  26.92 
 
 
433 aa  100  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0496  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.15 
 
 
449 aa  100  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0929  nucleotide sugar dehydrogenase  26.11 
 
 
416 aa  100  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0870  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  25 
 
 
427 aa  100  8e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.710609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  27.61 
 
 
448 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5563  NDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid dehydrogenase  27.27 
 
 
427 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0206  nucleotide sugar dehydrogenase  26.54 
 
 
420 aa  99.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  29.41 
 
 
424 aa  99.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0320263  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0456  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  27.05 
 
 
409 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000210605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4814  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.37 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2440  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  25.98 
 
 
426 aa  99  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406564  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0487  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 
413 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>