More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1709 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1530  nucleotide sugar dehydrogenase  79.51 
 
 
449 aa  744    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0496  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  78.84 
 
 
449 aa  748    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1766  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  76.61 
 
 
445 aa  716    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000194311 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1709  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 
449 aa  897    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.676622  normal  0.0907516 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1952  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase dimerisation  52.06 
 
 
460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.868357 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0203  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.27 
 
 
447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.211855  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3014  nucleotide sugar dehydrogenase  40.16 
 
 
544 aa  247  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5182  nucleotide sugar dehydrogenase  38.35 
 
 
503 aa  247  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3116  nucleotide sugar dehydrogenase  37 
 
 
424 aa  245  9e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000525581  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2029  nucleotide sugar dehydrogenase  36.97 
 
 
455 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1063  nucleotide sugar dehydrogenase  35.4 
 
 
433 aa  241  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  38.01 
 
 
437 aa  238  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0162  nucleotide sugar dehydrogenase  37.82 
 
 
420 aa  236  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454835  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2529  nucleotide sugar dehydrogenase  33.56 
 
 
418 aa  232  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000174279 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0488  nucleotide sugar dehydrogenase  35.33 
 
 
462 aa  229  7e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0347136  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  36.81 
 
 
432 aa  229  9e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08980  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  36.3 
 
 
436 aa  229  9e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.34 
 
 
438 aa  229  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5120  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  33.41 
 
 
427 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5512  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  33.41 
 
 
427 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5362  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  33.41 
 
 
427 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  36.18 
 
 
440 aa  227  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  35.78 
 
 
448 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4967  N-acylmannosamine 1-dehydrogenase (UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase); capsular polysaccharide synthesis enzyme  32.71 
 
 
427 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  35.78 
 
 
448 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.35 
 
 
420 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  36.84 
 
 
451 aa  223  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.14 
 
 
432 aa  223  7e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  36.36 
 
 
437 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0421  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  37.47 
 
 
414 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0562  putative polysaccharide biosynthesis protein  37.38 
 
 
414 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0487  putative polysaccharide biosynthesis protein  37.24 
 
 
413 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4103  nucleotide sugar dehydrogenase  36.28 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0429  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.98 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3696  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  35.2 
 
 
418 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1508  nucleotide sugar dehydrogenase  35.37 
 
 
434 aa  221  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0509  putative polysaccharide biosynthesis protein  36.77 
 
 
413 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  38.28 
 
 
453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.56 
 
 
439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.22 
 
 
449 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.52 
 
 
438 aa  219  6e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0560  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  37.91 
 
 
414 aa  219  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0417  UDP-N-acetyl-D-mannosamine 6-dehydrogenase  37 
 
 
414 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  36.41 
 
 
439 aa  218  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.64 
 
 
441 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165052  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4949  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.1 
 
 
427 aa  217  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.094226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.25 
 
 
418 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0961  nucleotide sugar dehydrogenase  35.52 
 
 
435 aa  216  5.9999999999999996e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08740  nucleotide sugar dehydrogenase  34.41 
 
 
433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.160472  normal  0.621032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5249  nucleotide sugar dehydrogenase  34.49 
 
 
446 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1675  nucleotide sugar dehydrogenase  38.01 
 
 
440 aa  216  9e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0154  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.35 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0149  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.35 
 
 
420 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.7 
 
 
448 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5563  NDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid dehydrogenase  33.1 
 
 
427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0335  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.35 
 
 
434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0353  nucleotide sugar dehydrogenase  37.35 
 
 
434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1016  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  33.33 
 
 
423 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20900  nucleotide sugar dehydrogenase  34.86 
 
 
441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5916  nucleotide sugar dehydrogenase  38.11 
 
 
424 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4278  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.98 
 
 
441 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0633  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.95 
 
 
435 aa  212  9e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.74 
 
 
435 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.13 
 
 
414 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2378  nucleotide sugar dehydrogenase  33.94 
 
 
460 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000447679  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.99 
 
 
434 aa  211  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0085  nucleotide sugar dehydrogenase  35.23 
 
 
431 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896059 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1195  nucleotide sugar dehydrogenase  35.21 
 
 
417 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100781  normal  0.218755 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2304  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.32 
 
 
457 aa  211  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4212  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.48 
 
 
433 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4030  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  34.18 
 
 
420 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0185  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  34.18 
 
 
420 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0515  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  34.18 
 
 
420 aa  210  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2117  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.31 
 
 
444 aa  210  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.95445  decreased coverage  0.00397041 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3939  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.71 
 
 
505 aa  209  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4419  nucleotide sugar dehydrogenase  35.75 
 
 
440 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0178  nucleotide sugar dehydrogenase  29.51 
 
 
427 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4814  putative polysaccharide biosynthesis protein  35.51 
 
 
414 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.75 
 
 
435 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4292  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.21 
 
 
440 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1857  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.4 
 
 
438 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0641  nucleotide sugar dehydrogenase  33.18 
 
 
427 aa  207  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3288  nucleotide sugar dehydrogenase  33.26 
 
 
453 aa  206  6e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178741  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1757  nucleotide sugar dehydrogenase  33.49 
 
 
437 aa  206  8e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1733  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.27 
 
 
427 aa  206  8e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.720088 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  35.14 
 
 
416 aa  205  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0442  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  35.12 
 
 
413 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6488  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.32 
 
 
419 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4134  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  33.03 
 
 
420 aa  204  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1591  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.05 
 
 
431 aa  204  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117032  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0870  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.57 
 
 
427 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.710609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1673  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.57 
 
 
435 aa  203  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4298  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  33.03 
 
 
420 aa  203  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3871  nucleotide sugar dehydrogenase  33.57 
 
 
407 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1457  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.29 
 
 
390 aa  204  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0554439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4189  nucleotide sugar dehydrogenase  33.03 
 
 
420 aa  203  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5220  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  33.03 
 
 
420 aa  203  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.248678  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03614  hypothetical protein  33.03 
 
 
420 aa  203  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4004  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  33.03 
 
 
420 aa  203  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4216  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  33.03 
 
 
420 aa  203  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>