More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2117 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2117  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
444 aa  888    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.95445  decreased coverage  0.00397041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4714  nucleotide sugar dehydrogenase  55.86 
 
 
450 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2174  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.27 
 
 
439 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0720947  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2378  nucleotide sugar dehydrogenase  32.81 
 
 
460 aa  240  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000447679  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1606  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.95 
 
 
477 aa  233  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3116  nucleotide sugar dehydrogenase  34.29 
 
 
424 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000525581  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0633  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.92 
 
 
435 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1766  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  36.54 
 
 
445 aa  225  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000194311 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2529  nucleotide sugar dehydrogenase  34.6 
 
 
418 aa  225  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000174279 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2029  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.48 
 
 
472 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0617  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.71 
 
 
450 aa  223  6e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0496  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.57 
 
 
449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1818  nucleotide sugar dehydrogenase  32.02 
 
 
426 aa  220  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000156601  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0049  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.75 
 
 
476 aa  219  7e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1139  NDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid dehydrogenase  32.39 
 
 
475 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1733  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.17 
 
 
427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.720088 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0178  nucleotide sugar dehydrogenase  31.54 
 
 
427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2807  nucleotide sugar dehydrogenase  30.79 
 
 
428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  35.35 
 
 
416 aa  216  9e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1063  nucleotide sugar dehydrogenase  36.22 
 
 
433 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0203  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.5 
 
 
447 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.211855  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2140  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.98 
 
 
476 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.493986 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  30.24 
 
 
432 aa  212  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1832  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.72 
 
 
476 aa  212  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213554  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2929  nucleotide sugar dehydrogenase  33.33 
 
 
424 aa  212  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0320263  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2214  nucleotide sugar dehydrogenase  30.18 
 
 
439 aa  212  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0680742  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1530  nucleotide sugar dehydrogenase  34.49 
 
 
449 aa  211  2e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1952  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase dimerisation  34.26 
 
 
460 aa  211  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.868357 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  29.75 
 
 
427 aa  210  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1709  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.31 
 
 
449 aa  210  5e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.676622  normal  0.0907516 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4949  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.75 
 
 
427 aa  209  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.094226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  29.16 
 
 
437 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5563  NDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid dehydrogenase  33.25 
 
 
427 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3187  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  36.56 
 
 
437 aa  206  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.878007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  31.75 
 
 
446 aa  206  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0870  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.03 
 
 
427 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.710609  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2304  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.67 
 
 
457 aa  206  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3871  nucleotide sugar dehydrogenase  33.57 
 
 
407 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  32.22 
 
 
453 aa  204  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08641  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.82 
 
 
403 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000650417 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0500  nucleotide sugar dehydrogenase  31.18 
 
 
440 aa  204  3e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.64439  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0085  nucleotide sugar dehydrogenase  36.6 
 
 
431 aa  204  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896059 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.45 
 
 
438 aa  203  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.92 
 
 
439 aa  203  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.48 
 
 
482 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7640  nucleotide sugar dehydrogenase  37.87 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1143  sugar dehydrogenase  32.63 
 
 
522 aa  199  6e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0027  nucleotide sugar dehydrogenase  36.73 
 
 
455 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1584  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32 
 
 
427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.260621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1673  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.57 
 
 
435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.17 
 
 
435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4618  nucleotide sugar dehydrogenase  34.04 
 
 
445 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000856439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4921  nucleotide sugar dehydrogenase  34.88 
 
 
469 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51327  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5083  nucleotide sugar dehydrogenase  34.04 
 
 
445 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.245157  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2997  nucleotide sugar dehydrogenase  32.97 
 
 
467 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218843  hitchhiker  0.00250768 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  36.36 
 
 
448 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.6 
 
 
449 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0210  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.75 
 
 
440 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125805  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1942  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  33.26 
 
 
428 aa  196  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.377359  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0929  nucleotide sugar dehydrogenase  30.77 
 
 
416 aa  196  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.5 
 
 
450 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0506  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  36.07 
 
 
412 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1478  NDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid dehydrogenase  30.19 
 
 
404 aa  195  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0138857  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  32.96 
 
 
440 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0149  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.6 
 
 
420 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1309  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.8 
 
 
450 aa  195  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0281238  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.5 
 
 
418 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  36.09 
 
 
448 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0154  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.6 
 
 
420 aa  195  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  34.43 
 
 
453 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.27 
 
 
441 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165052  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.15 
 
 
448 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.67 
 
 
435 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4967  N-acylmannosamine 1-dehydrogenase (UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase); capsular polysaccharide synthesis enzyme  31.59 
 
 
427 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1816  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.64 
 
 
453 aa  193  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3288  nucleotide sugar dehydrogenase  32 
 
 
453 aa  193  5e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.178741  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  33.04 
 
 
482 aa  193  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4542  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.05 
 
 
470 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2131  nucleotide sugar dehydrogenase  31.68 
 
 
417 aa  193  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3821  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.05 
 
 
470 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3703  nucleotide sugar dehydrogenase  33.05 
 
 
470 aa  193  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.757511  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6488  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.33 
 
 
419 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1858  nucleotide sugar dehydrogenase  33.7 
 
 
450 aa  192  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.840288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.44 
 
 
440 aa  192  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  31.17 
 
 
451 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5120  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  30.88 
 
 
427 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3696  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  34.86 
 
 
418 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2275  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.05 
 
 
470 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5512  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  30.88 
 
 
427 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.55 
 
 
473 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5362  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  30.88 
 
 
427 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5547  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.61 
 
 
470 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143587  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1408  nucleotide sugar dehydrogenase  31.01 
 
 
445 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0334536  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3736  nucleotide sugar dehydrogenase  31.78 
 
 
436 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.894229  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0956  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.65 
 
 
444 aa  191  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  32.43 
 
 
461 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3724  nucleotide sugar dehydrogenase  32.4 
 
 
470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4918  nucleotide sugar dehydrogenase  32.33 
 
 
470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103768  hitchhiker  0.000469095 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0270  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.59 
 
 
424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404114  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4052  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  35.43 
 
 
412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>