More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1766 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1530  nucleotide sugar dehydrogenase  75.95 
 
 
449 aa  716    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0496  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  75.28 
 
 
449 aa  716    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1766  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  100 
 
 
445 aa  890    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000194311 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1709  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  76.61 
 
 
449 aa  716    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.676622  normal  0.0907516 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1952  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase dimerisation  53.41 
 
 
460 aa  418  9.999999999999999e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.868357 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2029  nucleotide sugar dehydrogenase  37.16 
 
 
455 aa  261  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5182  nucleotide sugar dehydrogenase  37.62 
 
 
503 aa  254  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3014  nucleotide sugar dehydrogenase  37.64 
 
 
544 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  37.38 
 
 
437 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0203  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.88 
 
 
447 aa  250  3e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.211855  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0162  nucleotide sugar dehydrogenase  37.88 
 
 
420 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454835  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0488  nucleotide sugar dehydrogenase  36.04 
 
 
462 aa  241  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0347136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  36.26 
 
 
437 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1063  nucleotide sugar dehydrogenase  35.65 
 
 
433 aa  238  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3116  nucleotide sugar dehydrogenase  33.64 
 
 
424 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000525581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.53 
 
 
420 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  36.51 
 
 
432 aa  236  4e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.57 
 
 
438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5249  nucleotide sugar dehydrogenase  35.71 
 
 
446 aa  233  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.82 
 
 
435 aa  232  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4949  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.82 
 
 
427 aa  232  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.094226  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3696  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  35.45 
 
 
418 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  35.17 
 
 
440 aa  230  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.15 
 
 
448 aa  230  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.14 
 
 
435 aa  230  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0961  nucleotide sugar dehydrogenase  34.03 
 
 
435 aa  229  5e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  37.41 
 
 
453 aa  229  7e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5563  NDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid dehydrogenase  34.12 
 
 
427 aa  229  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  36.75 
 
 
448 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  35.63 
 
 
451 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  36.19 
 
 
416 aa  228  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  36.74 
 
 
448 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0178  nucleotide sugar dehydrogenase  32.09 
 
 
427 aa  226  6e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.41 
 
 
449 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2117  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.54 
 
 
444 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.95445  decreased coverage  0.00397041 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.78 
 
 
432 aa  225  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  35.31 
 
 
439 aa  225  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0085  nucleotide sugar dehydrogenase  36.43 
 
 
431 aa  224  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.896059 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0870  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.54 
 
 
427 aa  224  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.710609  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1675  nucleotide sugar dehydrogenase  38.21 
 
 
440 aa  223  8e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160013  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0429  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35.14 
 
 
423 aa  222  8e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2529  nucleotide sugar dehydrogenase  31.84 
 
 
418 aa  222  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000174279 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0353  nucleotide sugar dehydrogenase  37.26 
 
 
434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08980  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  35.55 
 
 
436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0335  UDP-glucose 6-dehydrogenase  37.26 
 
 
434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1016  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  34.42 
 
 
423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.61367  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5120  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  32.08 
 
 
427 aa  220  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4967  N-acylmannosamine 1-dehydrogenase (UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase); capsular polysaccharide synthesis enzyme  31.38 
 
 
427 aa  219  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5512  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  32.08 
 
 
427 aa  220  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5362  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  32.08 
 
 
427 aa  220  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  38.69 
 
 
418 aa  220  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1733  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31 
 
 
427 aa  219  5e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.720088 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.93 
 
 
439 aa  219  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0509  putative polysaccharide biosynthesis protein  35.68 
 
 
413 aa  219  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0562  putative polysaccharide biosynthesis protein  34.82 
 
 
414 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0484  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.98 
 
 
438 aa  218  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0421  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  34.82 
 
 
414 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0633  UDP-glucose 6-dehydrogenase  35 
 
 
435 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0487  putative polysaccharide biosynthesis protein  34.59 
 
 
413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2254  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  36 
 
 
414 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0560  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  35.13 
 
 
414 aa  217  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2378  nucleotide sugar dehydrogenase  35.27 
 
 
460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000447679  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6019  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  35.06 
 
 
414 aa  216  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.892071  normal  0.334278 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0423  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.85 
 
 
414 aa  216  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0417  UDP-N-acetyl-D-mannosamine 6-dehydrogenase  34.59 
 
 
414 aa  216  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.38 
 
 
441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0154  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.68 
 
 
420 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4103  nucleotide sugar dehydrogenase  34.41 
 
 
441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0149  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.68 
 
 
420 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0442  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  35.12 
 
 
413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1757  nucleotide sugar dehydrogenase  33.72 
 
 
437 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2863  nucleotide sugar dehydrogenase  34.52 
 
 
447 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2304  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.93 
 
 
457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5916  nucleotide sugar dehydrogenase  38.23 
 
 
424 aa  213  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1591  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  35.35 
 
 
431 aa  212  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117032  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20900  nucleotide sugar dehydrogenase  34.41 
 
 
441 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6488  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.99 
 
 
419 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4814  putative polysaccharide biosynthesis protein  35.21 
 
 
414 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4212  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.56 
 
 
433 aa  210  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0430  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  34.27 
 
 
416 aa  209  8e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0727334 
 
 
-
 
NC_002950  PG1277  UDP-glucose-6 dehydrogenase, putative  33.89 
 
 
421 aa  209  9e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3871  nucleotide sugar dehydrogenase  34.13 
 
 
407 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0641  nucleotide sugar dehydrogenase  34.03 
 
 
427 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3939  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.19 
 
 
505 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1854  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  34.19 
 
 
408 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0701839  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1457  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  37.96 
 
 
390 aa  207  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0554439  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1818  nucleotide sugar dehydrogenase  31.46 
 
 
426 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000156601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3999  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  32.18 
 
 
420 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.762398  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.83 
 
 
434 aa  207  4e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4278  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.65 
 
 
441 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4052  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  34.74 
 
 
412 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1857  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.17 
 
 
438 aa  206  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559599  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0049  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.82 
 
 
476 aa  206  8e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4189  nucleotide sugar dehydrogenase  31.63 
 
 
420 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4004  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  31.63 
 
 
420 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1818  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  33.41 
 
 
439 aa  205  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.387792  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03614  hypothetical protein  31.63 
 
 
420 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5220  UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  31.63 
 
 
420 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.248678  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2340  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.56 
 
 
439 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0699  UDP-glucose 6-dehydrogenase  34.81 
 
 
419 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>