More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0020 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1967  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  76.03 
 
 
549 aa  646    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220593 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0020  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  822    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0791294  normal  0.122064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1051  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  78.66 
 
 
560 aa  670    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3356  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  67.53 
 
 
565 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1688  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  34.04 
 
 
418 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.833152  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3852  nucleotide sugar dehydrogenase  33.57 
 
 
453 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0199691  normal  0.463935 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0961  nucleotide sugar dehydrogenase  32.72 
 
 
435 aa  145  9e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26760  nucleotide sugar dehydrogenase  29.51 
 
 
416 aa  142  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.84337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0376  UDP-glucose 6-dehydrogenase  32.04 
 
 
420 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2529  putative UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.45 
 
 
439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05630  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  29.49 
 
 
417 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0162  nucleotide sugar dehydrogenase  32.37 
 
 
420 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.454835  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0575  nucleotide sugar dehydrogenase  31.84 
 
 
432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4504  nucleotide sugar dehydrogenase  32.36 
 
 
451 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0636  nucleotide sugar dehydrogenase  30.88 
 
 
439 aa  130  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1309  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.32 
 
 
450 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0281238  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2807  nucleotide sugar dehydrogenase  31.37 
 
 
428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2863  nucleotide sugar dehydrogenase  29.03 
 
 
447 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2396  UDP-glucose 6-dehydrogenase  31.18 
 
 
435 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0335  UDP-glucose 6-dehydrogenase  33.09 
 
 
434 aa  126  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0353  nucleotide sugar dehydrogenase  33.09 
 
 
434 aa  126  7e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3083  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.68 
 
 
435 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1139  NDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid dehydrogenase  26.46 
 
 
475 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6488  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31 
 
 
419 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7640  nucleotide sugar dehydrogenase  29.24 
 
 
418 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2029  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  25.7 
 
 
472 aa  123  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0240  nucleotide sugar dehydrogenase  29.2 
 
 
453 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.836377  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1606  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.37 
 
 
477 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1238  nucleotide sugar dehydrogenase  30.89 
 
 
437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.836268  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2833  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  32.18 
 
 
448 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0049  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.93 
 
 
476 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2164  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  30.15 
 
 
471 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1339  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.78 
 
 
434 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1675  nucleotide sugar dehydrogenase  32.08 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160013  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3256  nucleotide sugar dehydrogenase  30.94 
 
 
437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4103  nucleotide sugar dehydrogenase  30.72 
 
 
441 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3843  nucleotide sugar dehydrogenase  27.63 
 
 
415 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0234219  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0023  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.89 
 
 
432 aa  116  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576582  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1832  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.11 
 
 
476 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213554  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0705  UDP-glucose 6-dehydrogenase  26.69 
 
 
438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000613921  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1952  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase dimerisation  27.65 
 
 
460 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.868357 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3939  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.35 
 
 
505 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1063  nucleotide sugar dehydrogenase  30.59 
 
 
433 aa  113  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3827  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.32 
 
 
438 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.10325  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0359  nucleotide sugar dehydrogenase  29.18 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4292  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.04 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1384  nucleotide sugar dehydrogenase  31.29 
 
 
448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2167  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  31.71 
 
 
442 aa  111  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.959713  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2529  nucleotide sugar dehydrogenase  30.58 
 
 
418 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000174279 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1480  nucleotide sugar dehydrogenase  30.94 
 
 
448 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0823  nucleotide sugar dehydrogenase  26.48 
 
 
493 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.473043  normal  0.732846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6764  nucleotide sugar dehydrogenase  29.73 
 
 
456 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0817646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0509  putative polysaccharide biosynthesis protein  28.26 
 
 
413 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4451  nucleotide sugar dehydrogenase  29.86 
 
 
441 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4429  nucleotide sugar dehydrogenase  29.68 
 
 
440 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2474  UDP-glucose 6-dehydrogenase  30.22 
 
 
449 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.323827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6571  nucleotide sugar dehydrogenase  30.5 
 
 
443 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.430897  normal  0.0960197 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3008  nucleotide sugar dehydrogenase  28.25 
 
 
436 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2140  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  26.55 
 
 
476 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.493986 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0210  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.96 
 
 
440 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.125805  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1312  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  26.61 
 
 
437 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1818  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  25.71 
 
 
439 aa  106  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.387792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1553  nucleotide sugar dehydrogenase  28.21 
 
 
440 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3187  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  27.86 
 
 
437 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.878007  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20900  nucleotide sugar dehydrogenase  27.53 
 
 
441 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1673  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.07 
 
 
435 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0203  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.16 
 
 
447 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.211855  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1299  UDP-glucose 6-dehydrogenase  29.3 
 
 
441 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.165052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2378  nucleotide sugar dehydrogenase  29.54 
 
 
460 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000447679  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3870  nucleotide sugar dehydrogenase  28.26 
 
 
442 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4278  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.47 
 
 
441 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0429  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.09 
 
 
423 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1229  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.77 
 
 
442 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.425997  normal  0.200381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2174  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.73 
 
 
439 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0720947  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1508  nucleotide sugar dehydrogenase  28.36 
 
 
434 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1917  nucleotide sugar dehydrogenase  26.26 
 
 
438 aa  103  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247022  hitchhiker  0.00141201 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5968  nucleotide sugar dehydrogenase  28.52 
 
 
445 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1766  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  29.54 
 
 
445 aa  103  6e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000194311 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0417  UDP-N-acetyl-D-mannosamine 6-dehydrogenase  26.55 
 
 
414 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4814  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 
414 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2856  UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronate dehydrogenase  29.34 
 
 
442 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.347972  hitchhiker  0.00000634421 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01511  VI polysaccharide biosynthesis protein VipA/tviB  27.43 
 
 
430 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.098059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0560  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  27.54 
 
 
414 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2440  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.42 
 
 
426 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406564  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0487  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.55 
 
 
413 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0488  nucleotide sugar dehydrogenase  26.1 
 
 
462 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0347136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0421  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein  26.55 
 
 
414 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1141  nucleotide sugar dehydrogenase  26.46 
 
 
461 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4589  UDP-glucose 6-dehydrogenase  28.88 
 
 
465 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338579  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1530  nucleotide sugar dehydrogenase  26.59 
 
 
449 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4419  nucleotide sugar dehydrogenase  29.63 
 
 
440 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0699  UDP-glucose 6-dehydrogenase  27.17 
 
 
419 aa  100  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136765  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0308  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/UDP-N-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase  29.7 
 
 
760 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5667  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.91 
 
 
442 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0209397 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1910  nucleotide sugar dehydrogenase  27.57 
 
 
437 aa  100  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0487  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.08 
 
 
447 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0496  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  27.91 
 
 
449 aa  99.8  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5563  NDP-N-acetyl-D-galactosaminuronic acid dehydrogenase  25.68 
 
 
427 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4949  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  26.28 
 
 
427 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.094226  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1709  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  28.3 
 
 
449 aa  99  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.676622  normal  0.0907516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>