40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3307 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3307  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 179 aa  370  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.350362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0806  rhodanese-like protein  43.27 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0555  rhodanese domain-containing protein  44.97 
 
 		 173 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1172  Rhodanese domain protein  43.92 
 
 		 173 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.561833 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1058  Rhodanese domain protein  38.17 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0279298 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1677  Rhodanese domain protein  42.24 
 
 		 174 aa  125  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0678  rhodanese-like protein  40.8 
 
 		 401 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.622569  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  31.36 
 
 		 432 aa  58.9  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2503  rhodanese-related sulfurtransferase  32 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.314097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1443  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 112 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.095571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1355  rhodanese-like protein  34.48 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100985  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  32.99 
 
 		 363 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  28.68 
 
 		 377 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4773  Rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 104 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0201355  hitchhiker  0.000148861 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2734  rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470499 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3940  hypothetical protein  39.13 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0418  Rhodanese domain protein  31.37 
 
 		 112 aa  48.9  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0713  rhodanese domain-containing protein  30.94 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0349  rhodanese domain-containing protein  30.08 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4476  rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  28.1 
 
 		 247 aa  45.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0504  rhodanese domain-containing protein  30.95 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0480  rhodanese domain-containing protein  34.83 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4001  rhodanese domain-containing protein  30.94 
 
 		 146 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4455  rhodanese domain-containing protein  29.13 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3363  rhodanese domain-containing protein  33.73 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3631  rhodanese-like protein  29.47 
 
 		 353 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161268  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0490  rhodanese domain-containing protein  29.2 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1903  rhodanese domain-containing protein  31.37 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.931871  decreased coverage  0.00875739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  30.68 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0489  rhodanese domain-containing protein  29.2 
 
 		 147 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3876  rhodanese domain-containing protein  28.68 
 
 		 147 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0483  rhodanese domain-containing protein  26.39 
 
 		 151 aa  42  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0480  hypothetical protein  33.73 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5980  hypothetical protein  36.36 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0649226  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  26.95 
 
 		 388 aa  41.2  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  35.59 
 
 		 689 aa  41.2  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0589  Rhodanese domain protein  32.22 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000910595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  29.85 
 
 		 125 aa  40.8  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  34 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>