More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2571 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 		 183 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  66.67 
 
 		 163 aa  192  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  66.17 
 
 		 180 aa  191  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5431  methionine-R-sulfoxide reductase  67.46 
 
 		 131 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.881722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  63.91 
 
 		 180 aa  187  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  60.87 
 
 		 137 aa  182  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  63.08 
 
 		 159 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  63.49 
 
 		 133 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  65.15 
 
 		 137 aa  180  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  61.65 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  65.62 
 
 		 135 aa  179  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1855  methionine sulfoxide reductase B  64.29 
 
 		 136 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  62.88 
 
 		 137 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  62.99 
 
 		 155 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  61.72 
 
 		 142 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  62.88 
 
 		 137 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  66.94 
 
 		 147 aa  176  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  64.06 
 
 		 138 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  58.39 
 
 		 148 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  61.07 
 
 		 136 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  64.57 
 
 		 132 aa  174  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  64.29 
 
 		 159 aa  173  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2039  methionine-R-sulfoxide reductase  64.52 
 
 		 131 aa  173  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.122601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  60.47 
 
 		 136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  62.9 
 
 		 164 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  62.4 
 
 		 140 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4765  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 		 131 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220604  normal  0.0308681 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  60.8 
 
 		 185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0880  methionine-R-sulfoxide reductase  61.42 
 
 		 138 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.286149  normal  0.443314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0853  methionine-R-sulfoxide reductase  61.42 
 
 		 138 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  62.79 
 
 		 140 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  60.32 
 
 		 134 aa  171  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  62.4 
 
 		 140 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4070  methionine-R-sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 132 aa  171  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000043688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0336  methionine-R-sulfoxide reductase  62.79 
 
 		 140 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  61.29 
 
 		 177 aa  170  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  59.4 
 
 		 142 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0325  methionine-S-oxide reductase  61.24 
 
 		 150 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231035  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0833  methionine-R-sulfoxide reductase  63.49 
 
 		 138 aa  170  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.151751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  64.52 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  61.42 
 
 		 138 aa  170  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5395  methionine-R-sulfoxide reductase  61.36 
 
 		 174 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.074958  normal  0.0409442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0873  methionine-R-sulfoxide reductase  63.49 
 
 		 138 aa  170  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0384215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1777  methionine sulfoxide reductase B  63.2 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  63.11 
 
 		 132 aa  168  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  62.2 
 
 		 139 aa  168  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  61.29 
 
 		 161 aa  168  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  59.12 
 
 		 142 aa  167  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  61.29 
 
 		 140 aa  167  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1063  methionine-R-sulfoxide reductase  60.94 
 
 		 137 aa  167  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803638  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0159  methionine-R-sulfoxide reductase  62.9 
 
 		 164 aa  167  7e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  63.93 
 
 		 137 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6665  methionine sulfoxide reductase B  52.66 
 
 		 176 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181254  normal  0.0736718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2492  methionine-R-sulfoxide reductase  57.04 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.177324  normal  0.194691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  61.29 
 
 		 135 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  60.48 
 
 		 128 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4430  methionine-R-sulfoxide reductase  61.6 
 
 		 152 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00419057  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  58.14 
 
 		 135 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3799  methionine-R-sulfoxide reductase  50.56 
 
 		 161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5232  methionine-R-sulfoxide reductase  59.52 
 
 		 131 aa  165  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.299585 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  61.48 
 
 		 133 aa  165  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  58.14 
 
 		 137 aa  165  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  61.29 
 
 		 128 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  58.78 
 
 		 189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  61.29 
 
 		 128 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  63.71 
 
 		 133 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0469  methionine-R-sulfoxide reductase  60 
 
 		 190 aa  164  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0046463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  60.16 
 
 		 133 aa  164  9e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2740  protein-methionine-S-oxide reductase  49.45 
 
 		 167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3070  methionine-R-sulfoxide reductase  62.4 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.972743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1425  methionine-R-sulfoxide reductase  60.32 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1817  methionine sulfoxide reductase B  58.14 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6721  methionine-R-sulfoxide reductase  62.02 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0799  methionine-R-sulfoxide reductase  61.9 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126104  normal  0.087393 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1586  protein-methionine-S-oxide reductase  62.02 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338285  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1522  methionine-R-sulfoxide reductase  61.11 
 
 		 167 aa  163  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2131  methionine-R-sulfoxide reductase  62.6 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0517033  normal  0.533919 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6245  methionine-R-sulfoxide reductase  62.02 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  0.670436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5538  methionine sulfoxide reductase B  60.48 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11463  normal  0.138366 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  63.56 
 
 		 144 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  57.48 
 
 		 140 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0221  protein-methionine-S-oxide reductase  61.29 
 
 		 163 aa  161  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3614  methionine sulfoxide reductase B  58.27 
 
 		 131 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199815  normal  0.296005 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  49.38 
 
 		 184 aa  160  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  59.02 
 
 		 136 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4459  methionine sulfoxide reductase B  61.29 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  56 
 
 		 130 aa  159  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  59.02 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5425  methionine-R-sulfoxide reductase  56.12 
 
 		 174 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  59.2 
 
 		 139 aa  158  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1275  methionine-R-sulfoxide reductase  59.06 
 
 		 134 aa  158  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285091  normal  0.167765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2617  peptide methionine sulfoxide reductase  59.06 
 
 		 134 aa  158  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0781659  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0645  methionine-R-sulfoxide reductase  58.87 
 
 		 161 aa  158  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0307048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1448  methionine sulfoxide reductase B  59.68 
 
 		 131 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.03902  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  59.5 
 
 		 154 aa  158  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  58.06 
 
 		 146 aa  158  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3982  methionine sulfoxide reductase B  58.27 
 
 		 131 aa  157  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.95519  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1330  methionine sulfoxide reductase B  57.35 
 
 		 171 aa  157  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2521  methionine sulfoxide reductase B  58.27 
 
 		 131 aa  157  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0744717  normal  0.336049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>