149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0789 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0789  lipopolysaccharide biosynthesis  100 
 
 		 408 aa  815    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2235  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.66 
 
 		 396 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.06 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  34.35 
 
 		 409 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.716445  hitchhiker  0.000227002 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3789  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.58 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1855  capsule polysaccharide export protein, putative  30.53 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0722635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1511  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.47 
 
 		 422 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1346  lipopolysaccharide biosynthesis  33.42 
 
 		 401 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000737646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1234  lipopolysaccharide biosynthesis  32.31 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2731  lipopolysaccharide biosynthesis  32.42 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2605  lipopolysaccharide biosynthesis protein  34.05 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3402  lipopolysaccharide biosynthesis  30.75 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0643  lipopolysaccharide biosynthesis protein  31.61 
 
 		 398 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3061  lipopolysaccharide biosynthesis protein  33.98 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1985  chain length determinant domain-containing protein  30.3 
 
 		 405 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1960  putative transport-related membrane protein  29.35 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.954505  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0661  chain length determinant protein  29.35 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0567  chain length determinant protein  29.35 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0889  lipopolysaccharide biosynthesis  27.49 
 
 		 428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.6181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2625  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00623391  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1888  hypothetical protein  31.98 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.173823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1780  capsular polysaccharide ABC transporter  24.5 
 
 		 372 aa  90.1  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1354  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.94 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  25.89 
 
 		 741 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  25.89 
 
 		 741 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.89 
 
 		 741 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  25.53 
 
 		 741 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  26.41 
 
 		 741 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  25.53 
 
 		 741 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  24.51 
 
 		 764 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  25.53 
 
 		 741 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  25.8 
 
 		 739 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  25.8 
 
 		 739 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  25.8 
 
 		 739 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  25.44 
 
 		 739 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1885  hypothetical protein  23.6 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0292  capsular polysaccharide export inner-membrane protein KpsE  24.86 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1689  exopolysaccharide transport protein family  26.84 
 
 		 744 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  19.79 
 
 		 720 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1619  capsular polysaccharide ABC transporter  23.57 
 
 		 372 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1439  capsular polysaccharide ABC transporter  23.57 
 
 		 372 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1959  capsular exopolysaccharide family  23.86 
 
 		 732 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.901256 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  23.86 
 
 		 740 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4703  exopolysaccharide transport protein family  20.54 
 
 		 747 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0507  exopolysaccharide transporter  22.75 
 
 		 740 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3733  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.73 
 
 		 780 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2298  tyrosine kinase  22.22 
 
 		 719 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250342  normal  0.402005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1940  exopolysaccharide transport protein family  22.07 
 
 		 755 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1086  exopolysaccharide transporter  23.81 
 
 		 734 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2456  tyrosine kinase  22.22 
 
 		 719 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0354521 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2241  tyrosine kinase  22.22 
 
 		 719 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0285  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 643 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2342  tyrosine kinase  22.22 
 
 		 719 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34409  normal  0.673103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2349  tyrosine kinase  22.22 
 
 		 719 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0284  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 		 642 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49921  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4053  exopolysaccharide transport protein family  22.69 
 
 		 740 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6747  exopolysaccharide transport protein family  21.3 
 
 		 740 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.417886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  21.65 
 
 		 806 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3694  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  22.38 
 
 		 726 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1726  exopolysaccharide transporter  23.18 
 
 		 746 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0320019  normal  0.507839 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4408  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 761 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.989897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1002  tyrosine kinase  22.18 
 
 		 720 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2366  chain length determinant protein EpsF  20.15 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  21.14 
 
 		 790 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  20.12 
 
 		 804 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  23.34 
 
 		 730 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01966  protein-tyrosine kinase  21.77 
 
 		 720 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1597  capsular exopolysaccharide family  21.77 
 
 		 720 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.818894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2995  tyrosine kinase  21.77 
 
 		 720 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00970433 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1172  tyrosine kinase  21.77 
 
 		 720 aa  60.1  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01955  hypothetical protein  21.77 
 
 		 720 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1581  tyrosine kinase  21.77 
 
 		 720 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2674  tyrosine kinase  19.34 
 
 		 720 aa  60.1  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2353  tyrosine kinase  21.77 
 
 		 720 aa  59.7  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  24.19 
 
 		 745 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3850  protein-tyrosine kinase  26.94 
 
 		 784 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2472  exopolysaccharide transport protein family  21.46 
 
 		 741 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.342499  normal  0.203654 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03061  putative capsule polysaccharide export system inner membrane protein  21.52 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.244553  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00984  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  21.43 
 
 		 726 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2662  capsular exopolysaccharide family  21.43 
 
 		 726 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.149577  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2255  protein-tyrosine kinase  21.95 
 
 		 736 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.962919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2334  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  21.43 
 
 		 726 aa  58.9  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00991  hypothetical protein  21.43 
 
 		 726 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.486912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1217  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  21.43 
 
 		 726 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1090  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  21.43 
 
 		 726 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1097  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  21.43 
 
 		 726 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2615  cryptic autophosphorylating protein tyrosine kinase Etk  21.43 
 
 		 726 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.662631  normal  0.0600868 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  24.19 
 
 		 746 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  24.19 
 
 		 747 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  21.93 
 
 		 727 aa  57.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6020  capsular exopolysaccharide family  22.4 
 
 		 736 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2025  lipopolysaccharide biosynthesis  21.84 
 
 		 469 aa  56.2  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.97283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  21.12 
 
 		 802 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3225  protein-tyrosine kinase  24.28 
 
 		 735 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119763  normal  0.295148 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2236  lipopolysaccharide biosynthesis protein  50 
 
 		 227 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0649  putative lipopolysaccharide biosynthesis tyrosine kinase  19.31 
 
 		 753 aa  53.9  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  22.79 
 
 		 733 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3443  tyrosine-protein kinase  24.9 
 
 		 753 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2191  tyrosine-protein kinase etk  18.55 
 
 		 722 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174737  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0845  capsular exopolysaccharide family  25 
 
 		 784 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>