72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0932 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0932  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  512  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0883  hypothetical protein  60.34 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1518  hypothetical protein  53.09 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0597975  normal  0.67019 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1273  extracellular solute-binding protein family 3  54.62 
 
 		 250 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.757489  normal  0.0285776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3104  hypothetical protein  54.62 
 
 		 250 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796151  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3247  hypothetical protein  54.62 
 
 		 250 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3094  hypothetical protein  54.62 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2896  hypothetical protein  56.48 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2813  hypothetical protein  56.48 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2993  amino acid ABC transporter periplasmic protein  53.07 
 
 		 249 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0805  hypothetical protein  54.43 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3522  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.15 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.389292 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0301  extracellular solute-binding protein family 3  25.11 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.133658 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0336  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.37 
 
 		 333 aa  62  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3410  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  23.63 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1824  hypothetical protein  25.32 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0729665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1047  extracellular solute-binding protein  21.81 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.519655  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1440  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.1259 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.58 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3647  hypothetical protein  24.51 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0875427  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4645  hypothetical protein  29.09 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1028  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.729894 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1500  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  21.32 
 
 		 270 aa  52  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238692  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  23.11 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2745  extracellular solute-binding protein family 3  20.93 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2551  extracellular solute-binding protein  21.68 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.36291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4839  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 250 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000733894  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1047  hypothetical protein  27.67 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0823  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5575  extracellular solute-binding protein  21.89 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.141446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1071  extracellular solute-binding protein  20.18 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  29.93 
 
 		 285 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000985  ABC-type amino acid transport/signal transduction system  21.19 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  38.67 
 
 		 277 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.17 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  21.52 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1391  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  29.93 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2369  extracellular solute-binding protein  21.12 
 
 		 256 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 270 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0100  extracellular solute-binding protein family 3  23.67 
 
 		 251 aa  45.4  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.246862  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0434  arginine-binding periplasmic protein 1  22.09 
 
 		 246 aa  45.8  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2829  extracellular solute-binding protein family 3  26.02 
 
 		 266 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3802  hypothetical protein  23.71 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0117  extracellular solute-binding protein family 3  22.38 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0187  extracellular solute-binding protein  22.08 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.056665 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.93 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  31.69 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  31.69 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1060  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.703174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  31.69 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1200  hypothetical protein  26.67 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.285337  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  24.4 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0360  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.974296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  29.2 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4862  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.463107 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  29.2 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0056  transporter, putative  19.91 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  29.2 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  29.2 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  29.2 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2454  extracellular solute-binding protein family 3  22.86 
 
 		 292 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0087  hypothetical protein  27.15 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 264 aa  42  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2107  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.65 
 
 		 253 aa  42  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0102  hypothetical protein  26.35 
 
 		 242 aa  42  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07039  hypothetical protein  21.26 
 
 		 251 aa  42  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.87 
 
 		 264 aa  42  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>