55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4893 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4893  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6046  hypothetical protein  42.86 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4613  hypothetical protein  37.14 
 
 		 277 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000441366 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03602  hypothetical protein  43.88 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3243  hypothetical protein  41.36 
 
 		 180 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0358  putative restriction endonuclease  41.86 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2664  hypothetical protein  40.94 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.945475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0825  hypothetical protein  39.58 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.98901 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0209  hypothetical protein  39.42 
 
 		 315 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  hitchhiker  0.00000108217 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4521  hypothetical protein  39.42 
 
 		 328 aa  99  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1054  hypothetical protein  44.26 
 
 		 375 aa  97.8  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.09564  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3983  hypothetical protein  40.71 
 
 		 323 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.612254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1177  restriction endonuclease-like protein  40.94 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1523  putative restriction endonuclease  32.02 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.74121  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4706  hypothetical protein  38.57 
 
 		 311 aa  92.4  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0127144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0501  restriction endonuclease  40.15 
 
 		 295 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0271  putative restriction endonuclease  45.63 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.788002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2246  hypothetical protein  35.56 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0492047 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1104  hypothetical protein  34.13 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0146  hypothetical protein  34.09 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1468  hypothetical protein  38.05 
 
 		 304 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.978213  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1267  hypothetical protein  38.05 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0933  restriction endonuclease  34.04 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  hitchhiker  0.00000000169325 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6007  putative restriction endonuclease  35.16 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2091  hypothetical protein  33.62 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0972757  normal  0.149927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5044  hypothetical protein  34.29 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.899608 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3648  hypothetical protein  35.56 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4171  putative restriction endonuclease  36.08 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118239  normal  0.3128 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0490  hypothetical protein  36.36 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3520  hypothetical protein  34.81 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3867  restriction endonuclease-like  42.05 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3975  restriction endonuclease-like protein  42.05 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8704  restriction endonuclease  39.77 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0062  putative restriction endonuclease  35.92 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2006  hypothetical protein  38.46 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.398772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4781  putative restriction endonuclease  37.89 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1360  hypothetical protein  35.85 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0409  hypothetical protein  33.59 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0625  hypothetical protein  31.79 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4010  restriction endonuclease-like protein  35.58 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3245  hypothetical protein  34.02 
 
 		 271 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3143  TPR repeat-containing protein  42.65 
 
 		 424 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.34299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1547  restriction endonuclease  34.09 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.337245  normal  0.907295 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2247  restriction endonuclease  28.8 
 
 		 304 aa  48.9  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1981  hypothetical protein  40.54 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00131124  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4145  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3543  hypothetical protein  33.68 
 
 		 462 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3387  hypothetical protein  29.87 
 
 		 262 aa  45.4  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0757  hypothetical protein  31.71 
 
 		 358 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1252  restriction endonuclease  32.95 
 
 		 306 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0119722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6652  hypothetical protein  35.06 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.9585  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0273  hypothetical protein  32.5 
 
 		 416 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3777  hypothetical protein  28.26 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.298649  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1314  restriction endonuclease-like protein  37.97 
 
 		 313 aa  42.7  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173564  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0911  restriction endonuclease  23.35 
 
 		 313 aa  42  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>