52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2225 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2225  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  40.87 
 
 		 202 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2951  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  39.64 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2731  hypothetical protein  36.82 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1628  hypothetical protein  36.82 
 
 		 245 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936248 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2824  hypothetical protein  37.24 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2748  hypothetical protein  37.24 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668199  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2267  hypothetical protein  36.1 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.311902 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3437  hypothetical protein  42.79 
 
 		 203 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2426  hypothetical protein  38.03 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  37.9 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  37.19 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  36.55 
 
 		 229 aa  105  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1833  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  35.27 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  29.13 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02165  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  28.24 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.892695  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  27.93 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  24.32 
 
 		 394 aa  65.5  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  26.32 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.51 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  30.14 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  22.97 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  29.63 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  22.94 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  28.21 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  28.24 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  24.45 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  27.78 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  24.67 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  29.33 
 
 		 190 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  26.42 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  28 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  27.51 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  21.68 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.64 
 
 		 539 aa  48.9  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  26.27 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1573  hypothetical protein  31.3 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0210508  normal  0.559729 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  27.8 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  27.35 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  30.77 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  30 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  29.23 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  25.88 
 
 		 538 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1484  hypothetical protein  23.58 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205253  normal  0.364405 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.79 
 
 		 538 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  24.41 
 
 		 187 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  28.11 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  27.5 
 
 		 200 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  24.84 
 
 		 194 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.25 
 
 		 204 aa  42.4  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  26.67 
 
 		 210 aa  42  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0243  MobA-like protein  23.58 
 
 		 216 aa  42  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00192406  normal  0.367058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>